More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02671 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  100 
 
 
188 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  46.7 
 
 
191 aa  175  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  46.63 
 
 
189 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  42.86 
 
 
188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  40.96 
 
 
185 aa  154  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  45.14 
 
 
189 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  37.43 
 
 
196 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  43.31 
 
 
192 aa  121  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  36.9 
 
 
191 aa  121  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  40 
 
 
182 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  37.37 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  39.38 
 
 
153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  30.85 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  32.63 
 
 
189 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  37.5 
 
 
181 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  34.57 
 
 
188 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  34.57 
 
 
188 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  34.13 
 
 
156 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  41.84 
 
 
128 aa  99  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  28.81 
 
 
355 aa  75.5  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  30.48 
 
 
104 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  35.37 
 
 
146 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  35.37 
 
 
146 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  37.04 
 
 
108 aa  62  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  34.07 
 
 
106 aa  61.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  29.63 
 
 
107 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  32.94 
 
 
106 aa  60.8  0.00000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  31.82 
 
 
106 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  33.72 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  32.93 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  32.93 
 
 
108 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  32.93 
 
 
108 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  32.56 
 
 
108 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  33.72 
 
 
108 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  36.96 
 
 
125 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  31.4 
 
 
108 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37354  predicted protein  31.52 
 
 
131 aa  59.3  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0644454  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  32.56 
 
 
108 aa  58.9  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  37.5 
 
 
104 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  30.23 
 
 
108 aa  58.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  33.33 
 
 
105 aa  58.5  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  34.57 
 
 
108 aa  58.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  25 
 
 
111 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  31.4 
 
 
109 aa  58.2  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  33.33 
 
 
108 aa  58.2  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  30.12 
 
 
108 aa  58.2  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  34.44 
 
 
106 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  57.8  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  31.4 
 
 
108 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  34.44 
 
 
106 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  29.63 
 
 
108 aa  57.4  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  35.56 
 
 
106 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  31.4 
 
 
108 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  34.57 
 
 
108 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  33.73 
 
 
108 aa  57.4  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  32.1 
 
 
108 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  29.63 
 
 
108 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  26 
 
 
109 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  34.57 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  31.71 
 
 
106 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  27.91 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  29.63 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  35.56 
 
 
106 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  34.15 
 
 
106 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  26.88 
 
 
110 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  35.37 
 
 
107 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  30.49 
 
 
107 aa  57  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  32.93 
 
 
105 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  29.63 
 
 
112 aa  56.2  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  29.55 
 
 
113 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  32.1 
 
 
108 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  30.68 
 
 
106 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  29.63 
 
 
112 aa  56.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  31.31 
 
 
108 aa  55.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  26 
 
 
108 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  28.72 
 
 
108 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  28.7 
 
 
112 aa  55.5  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>