More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_02641 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  100 
 
 
156 aa  313  5e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  88.24 
 
 
153 aa  280  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  75.97 
 
 
181 aa  241  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  66.88 
 
 
182 aa  211  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  31.97 
 
 
188 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  33.96 
 
 
185 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  28.24 
 
 
191 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  34.13 
 
 
188 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  32.7 
 
 
196 aa  97.8  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  45.65 
 
 
189 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  35.88 
 
 
192 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  33.96 
 
 
188 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  33.96 
 
 
188 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  41.41 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  45.05 
 
 
189 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  31.47 
 
 
193 aa  94  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  32.82 
 
 
191 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  33.57 
 
 
182 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  32.64 
 
 
189 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  34.07 
 
 
355 aa  70.9  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  36.14 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  35.16 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  36.14 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  31.03 
 
 
290 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  34.48 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  37.21 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  34.12 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  30.17 
 
 
285 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  33.73 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  31.46 
 
 
110 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  36.05 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  28.18 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  26.26 
 
 
259 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  25.66 
 
 
289 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  32.63 
 
 
406 aa  57.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  25.66 
 
 
289 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  30.93 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  32.56 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  26.55 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  36.49 
 
 
109 aa  57.4  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  27.78 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  29.89 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  33.71 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  33.71 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  33.71 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  34.88 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  36.11 
 
 
104 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  29.76 
 
 
290 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  29.89 
 
 
290 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  33.71 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  33.71 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  27.37 
 
 
259 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  33.72 
 
 
108 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  30.68 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  32.18 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  32.56 
 
 
421 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  35.14 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  29.89 
 
 
290 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  29.89 
 
 
290 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  34.83 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0780  Redoxin domain protein  30.97 
 
 
471 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  33.73 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  29.89 
 
 
290 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  29.9 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  29.17 
 
 
406 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  27.27 
 
 
257 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  31.65 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  28.09 
 
 
290 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  28.57 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  26.36 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  26.36 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  33.72 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  29.41 
 
 
290 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  32.58 
 
 
272 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  25.27 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  25.66 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  32.58 
 
 
272 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  28.89 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  30.85 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  27.84 
 
 
289 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  31.76 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  35.06 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  35.06 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  33.72 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  32.18 
 
 
107 aa  54.7  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  32.43 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  30.68 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  24.55 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  33.77 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  30.85 
 
 
286 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  27.27 
 
 
268 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  26.05 
 
 
289 aa  54.3  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  36.49 
 
 
108 aa  54.3  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  36.99 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  32.88 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>