More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3340 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 182 aa  377  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  64.86 
 
 		 188 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  64.86 
 
 		 188 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  55.75 
 
 		 196 aa  216  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  52.25 
 
 		 192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  55.93 
 
 		 193 aa  212  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  50.89 
 
 		 189 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  48.02 
 
 		 191 aa  179  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  40 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  44.96 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  36.75 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  32.02 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  35.86 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  38.22 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  36.73 
 
 		 189 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  32.93 
 
 		 182 aa  94.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  35.71 
 
 		 153 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  33.09 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  34.29 
 
 		 355 aa  88.6  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  33.57 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  38.04 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  35.16 
 
 		 108 aa  67  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  35.87 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  35.87 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  35.87 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  35.79 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  35.56 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  33.7 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  37.5 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  37.5 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  35.87 
 
 		 108 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  34.78 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  33.7 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  33.67 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  36.17 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  32.63 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  36.36 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  32.99 
 
 		 107 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  32.63 
 
 		 105 aa  60.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  34.38 
 
 		 107 aa  60.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  37.35 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  34.94 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  34.04 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  35.16 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  35.87 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  41.77 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  26.09 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  34.38 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  29.9 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  37.5 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  31.91 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  33.71 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  35.16 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  32.29 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  32.29 
 
 		 289 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  33.71 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  32.63 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  31.58 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  31.58 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  30.53 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  31.58 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  31.58 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  28.87 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  30.53 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  32.97 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  32.32 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  35 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  33.68 
 
 		 109 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1859  thioredoxin  30.36 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.263827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  35.29 
 
 		 104 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  31.73 
 
 		 286 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.41 
 
 		 810 aa  57.4  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  35.56 
 
 		 110 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  30.48 
 
 		 105 aa  57.4  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  30.93 
 
 		 108 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  32.94 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  28.89 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  34.07 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  34.78 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  29.17 
 
 		 109 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>