More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1263 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
189 aa  386  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  55.08 
 
 
192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  55.37 
 
 
196 aa  214  7e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  51.69 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  50.89 
 
 
182 aa  197  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  52.49 
 
 
188 aa  194  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  52.49 
 
 
188 aa  194  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  47.89 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  33.85 
 
 
191 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  40.48 
 
 
128 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  32.63 
 
 
188 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  33.53 
 
 
188 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  38.81 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  34.91 
 
 
182 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  36.36 
 
 
355 aa  92  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  32.86 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  34.03 
 
 
153 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  28.27 
 
 
189 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  32.64 
 
 
156 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  28.72 
 
 
189 aa  84.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  32.41 
 
 
406 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  32.58 
 
 
108 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  31.46 
 
 
108 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  34.33 
 
 
146 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0227  thioredoxin-related  35.71 
 
 
130 aa  60.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  30.34 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  34.33 
 
 
146 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  35.23 
 
 
107 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  30.34 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  31.46 
 
 
108 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  34.33 
 
 
108 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  34.33 
 
 
108 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  30.93 
 
 
111 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  34.33 
 
 
108 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  34.33 
 
 
108 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  34.33 
 
 
108 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  34.33 
 
 
108 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37354  predicted protein  35.53 
 
 
131 aa  58.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0644454  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  30.59 
 
 
107 aa  58.2  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  29.41 
 
 
108 aa  57.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  31.52 
 
 
98 aa  57.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5974  thioredoxin domain protein  32.29 
 
 
102 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.897668  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  32.22 
 
 
107 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  30.77 
 
 
104 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  33.68 
 
 
110 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  32 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  32.26 
 
 
109 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  31.76 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  27.66 
 
 
257 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  35.82 
 
 
109 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  32.26 
 
 
107 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32.58 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  30 
 
 
106 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  32.84 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  28.72 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  32.84 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  27.66 
 
 
108 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  32.26 
 
 
109 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  33.33 
 
 
109 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  30 
 
 
106 aa  55.5  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  30.59 
 
 
108 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  30.38 
 
 
106 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  28.12 
 
 
115 aa  55.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  26.88 
 
 
107 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  32.84 
 
 
110 aa  55.1  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  31.03 
 
 
106 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  31.03 
 
 
106 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  23.96 
 
 
110 aa  55.1  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  26.8 
 
 
105 aa  55.1  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  26.6 
 
 
259 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  29.03 
 
 
107 aa  54.7  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  29.79 
 
 
107 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  30.85 
 
 
109 aa  54.7  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  38.1 
 
 
107 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  29.29 
 
 
104 aa  54.7  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  29.03 
 
 
107 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  29.03 
 
 
107 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  34.07 
 
 
108 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  27.38 
 
 
108 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  32.84 
 
 
109 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  31.03 
 
 
106 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  27.66 
 
 
108 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  33.8 
 
 
106 aa  54.3  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  28.09 
 
 
113 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  30.68 
 
 
105 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  27.54 
 
 
109 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  31.34 
 
 
108 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  32.84 
 
 
108 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  28.24 
 
 
108 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  25.26 
 
 
109 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  29.73 
 
 
108 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  28.24 
 
 
108 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>