More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1608 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  93.12 
 
 		 189 aa  333  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  45.41 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  44.51 
 
 		 191 aa  184  5e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  46.58 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  44.51 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  34.43 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  37.43 
 
 		 196 aa  110  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  36.42 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  36.54 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  32.28 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  48.39 
 
 		 128 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  36.42 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  29.79 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  34.18 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  34.18 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  37.27 
 
 		 153 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  44.12 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  28.11 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  36.36 
 
 		 355 aa  67  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.21 
 
 		 604 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  28.57 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.8 
 
 		 595 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.8 
 
 		 595 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.8 
 
 		 595 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  28.57 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  31.13 
 
 		 109 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  29.52 
 
 		 110 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  29.52 
 
 		 110 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 611 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.21 
 
 		 613 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.21 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.05 
 
 		 619 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.21 
 
 		 613 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  28.57 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.21 
 
 		 610 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.18 
 
 		 619 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  31 
 
 		 609 aa  58.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.52 
 
 		 567 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.52 
 
 		 567 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  36.36 
 
 		 105 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  27.62 
 
 		 110 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  32.65 
 
 		 104 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.05 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  27.62 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.86 
 
 		 619 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  26.67 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.06 
 
 		 600 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 567 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 567 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.14 
 
 		 606 aa  55.5  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.99 
 
 		 592 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 567 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  29.63 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  23.03 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  34.38 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  29.76 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  32.05 
 
 		 368 aa  54.7  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.36 
 
 		 466 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  28.89 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.56 
 
 		 602 aa  54.7  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  36.84 
 
 		 604 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  30.39 
 
 		 106 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  27.45 
 
 		 104 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.89 
 
 		 628 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  34.94 
 
 		 108 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  31.43 
 
 		 102 aa  54.3  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  34.52 
 
 		 603 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  30.95 
 
 		 110 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 565 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  33.33 
 
 		 565 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 565 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  34.62 
 
 		 608 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 565 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 565 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  28.85 
 
 		 108 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  33.33 
 
 		 565 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 565 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 565 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  27.88 
 
 		 108 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  30.34 
 
 		 108 aa  53.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  34.12 
 
 		 731 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  29.81 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  34.15 
 
 		 471 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  28.85 
 
 		 108 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  30.48 
 
 		 108 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 565 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  28.85 
 
 		 108 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  31.03 
 
 		 107 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  25.64 
 
 		 109 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  32.53 
 
 		 109 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  29.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  29.13 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>