More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_9748 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  100 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  45.37 
 
 
108 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  45.37 
 
 
108 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  45.37 
 
 
108 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  45.37 
 
 
108 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  45.37 
 
 
108 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  45.37 
 
 
108 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  45.37 
 
 
108 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  45.71 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  45.71 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  47.06 
 
 
108 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  43.52 
 
 
108 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  43.52 
 
 
108 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  43.52 
 
 
108 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  43.52 
 
 
108 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  43.52 
 
 
108 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  43.52 
 
 
108 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  45.1 
 
 
108 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  45.1 
 
 
108 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0160  thioredoxin-related  49.07 
 
 
111 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  46.3 
 
 
111 aa  104  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  46.08 
 
 
108 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  43.14 
 
 
108 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  43.27 
 
 
107 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  42.71 
 
 
108 aa  101  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  45.1 
 
 
107 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2121  Thioredoxin domain protein  43.4 
 
 
112 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.427267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0912  thioredoxin domain-containing protein  45.37 
 
 
111 aa  100  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  42.27 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  46.6 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  42.72 
 
 
106 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  41.75 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  42.59 
 
 
108 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  46.6 
 
 
106 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  48.91 
 
 
107 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  40.57 
 
 
108 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  40.57 
 
 
108 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  44.34 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  46.23 
 
 
106 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  41.51 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  46.6 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  46.08 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  45.71 
 
 
106 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  40.2 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  42.86 
 
 
108 aa  97.1  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  42.45 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1775  thioredoxin  47.31 
 
 
92 aa  97.1  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  48.86 
 
 
111 aa  97.1  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  45.54 
 
 
106 aa  96.7  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  44.34 
 
 
108 aa  96.7  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  44.12 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  43.4 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  49 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  41.9 
 
 
109 aa  95.9  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  44.76 
 
 
106 aa  95.9  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  43.4 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  45.54 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2143  Thioredoxin domain protein  43.4 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  40.95 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  44 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  44.71 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  40 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  46.91 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  47 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  44.34 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  44.12 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  45.1 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  41.67 
 
 
109 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  40.57 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  40.78 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  43.3 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  41.51 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  43.81 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  45.63 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  44.71 
 
 
108 aa  94  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  40.62 
 
 
108 aa  94  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  93.6  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0945  thioredoxin domain-containing protein  46.67 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  45.19 
 
 
106 aa  93.6  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  44.33 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  43.81 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  39.81 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  43.14 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  40 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  43.69 
 
 
112 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  44.76 
 
 
109 aa  92.8  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  45.24 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  40.21 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  42.71 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  43.69 
 
 
112 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  40 
 
 
125 aa  92  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  41.51 
 
 
109 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  44.66 
 
 
106 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  42.45 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  45.88 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  39.05 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  40 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>