More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2143 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2143  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 108 aa  223  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3868  Thioredoxin domain protein  68.81 
 
 		 118 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  68.81 
 
 		 109 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0160  thioredoxin-related  64.76 
 
 		 111 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0912  thioredoxin domain-containing protein  60.38 
 
 		 111 aa  143  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0945  thioredoxin domain-containing protein  57.55 
 
 		 109 aa  133  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2121  Thioredoxin domain protein  54.63 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.427267 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  50 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1775  thioredoxin  53.26 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  45.79 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  44.86 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  44.76 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  42.31 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  42.59 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  42.16 
 
 		 108 aa  103  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  42.16 
 
 		 108 aa  103  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  42.16 
 
 		 108 aa  103  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  42.16 
 
 		 108 aa  103  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  42.06 
 
 		 107 aa  103  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  42.16 
 
 		 108 aa  103  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  42.16 
 
 		 108 aa  103  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  40.38 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  41.35 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  40.2 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  41.35 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  41.9 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  40.59 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  40.38 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  42.59 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  41.75 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  41.35 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  41.35 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  42.2 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  39.62 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  42.06 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  40.2 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  40.2 
 
 		 106 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  40.37 
 
 		 111 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  41.9 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  38.1 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  41.12 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  42.06 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  42.31 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  42.59 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  42.06 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  42 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  41.18 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  43.27 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  42.06 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  43.4 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  38.1 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  41.18 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  44.76 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  40.2 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  40.38 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  41.58 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  39.62 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  38.61 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  42.06 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  40.95 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  38.61 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  42.06 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  39.22 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  39.6 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  38.53 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  39.81 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  44.76 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  39.42 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  39.6 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  46.15 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40.19 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  40.38 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  39.45 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  44.76 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  42.31 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  40.19 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  40.19 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  41.12 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  40.38 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  40.37 
 
 		 109 aa  97.1  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  40.2 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  40.2 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  40.37 
 
 		 109 aa  97.1  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  42.06 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  40.2 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  41.35 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>