More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0338 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  100 
 
 
192 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  69.39 
 
 
196 aa  295  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  59.09 
 
 
193 aa  234  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  55.08 
 
 
189 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  52.25 
 
 
182 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  54.95 
 
 
188 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  54.95 
 
 
188 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  49.45 
 
 
191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  47.62 
 
 
128 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  43.31 
 
 
188 aa  121  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  30.94 
 
 
191 aa  111  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  34.24 
 
 
189 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  32.79 
 
 
189 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  35.71 
 
 
185 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  36.64 
 
 
181 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  29.89 
 
 
188 aa  101  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  35.56 
 
 
182 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  35.88 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  34.35 
 
 
153 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  33.92 
 
 
355 aa  94.4  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  33.7 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  38.55 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  35.48 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  32.04 
 
 
406 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  37.35 
 
 
106 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  37.35 
 
 
106 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  34.74 
 
 
107 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  33.33 
 
 
105 aa  62.8  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  31.96 
 
 
105 aa  62.8  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  37.89 
 
 
106 aa  62.4  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  32.98 
 
 
107 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  60.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  29.67 
 
 
108 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  36.17 
 
 
109 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  37.93 
 
 
125 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  37.97 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  40 
 
 
103 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  36.71 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  35.11 
 
 
107 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  36.71 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  36.71 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  36.71 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  36.71 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  36.78 
 
 
107 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  36.71 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  36.71 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  36.17 
 
 
107 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  31.91 
 
 
106 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  30.77 
 
 
130 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  35.44 
 
 
108 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  32.99 
 
 
108 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  33.33 
 
 
115 aa  58.9  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  35.96 
 
 
104 aa  58.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  34.18 
 
 
146 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  32.99 
 
 
108 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  32.99 
 
 
108 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  31.91 
 
 
107 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  31.91 
 
 
107 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  31.91 
 
 
107 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  32.61 
 
 
106 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  31.96 
 
 
108 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  32.58 
 
 
106 aa  58.2  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  30 
 
 
107 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  35.44 
 
 
108 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  35.44 
 
 
108 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  34.74 
 
 
107 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  39.24 
 
 
108 aa  58.2  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  34.18 
 
 
146 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  32.56 
 
 
107 aa  57.8  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  30.61 
 
 
106 aa  57.8  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  38.2 
 
 
109 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  28.89 
 
 
88 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  32.98 
 
 
109 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  38.2 
 
 
109 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  37.08 
 
 
109 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  31.76 
 
 
125 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  35.44 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  29.07 
 
 
257 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  35.44 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  37.08 
 
 
109 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  35.44 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  33.72 
 
 
112 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  31.82 
 
 
105 aa  56.6  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  31.4 
 
 
141 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  35.44 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  34.52 
 
 
107 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  35.44 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  33.72 
 
 
112 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  35.44 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  37.97 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  34.18 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  32.56 
 
 
107 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  39.19 
 
 
106 aa  55.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  34.83 
 
 
109 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  26.6 
 
 
125 aa  55.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  30.85 
 
 
112 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  33.96 
 
 
105 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  29.47 
 
 
105 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  31.87 
 
 
109 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>