More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2070 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  100 
 
 
185 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  66.84 
 
 
191 aa  263  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  56.02 
 
 
188 aa  221  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  44.69 
 
 
189 aa  174  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  43.62 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  40.96 
 
 
188 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  35.56 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  35.9 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  34.46 
 
 
192 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  36.48 
 
 
153 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  32.2 
 
 
196 aa  111  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  37.27 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  31.43 
 
 
182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  39.18 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  33.96 
 
 
156 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  34.43 
 
 
188 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  34.43 
 
 
188 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  37.9 
 
 
128 aa  98.6  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  32.2 
 
 
193 aa  97.8  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  36.36 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  37.23 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  37.04 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  37.78 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  39.24 
 
 
109 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  34.62 
 
 
104 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  29.13 
 
 
110 aa  61.6  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  37 
 
 
110 aa  61.6  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.26 
 
 
627 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  32.26 
 
 
627 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.26 
 
 
627 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  27.68 
 
 
133 aa  61.6  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.26 
 
 
627 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.26 
 
 
627 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.26 
 
 
627 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  32.58 
 
 
128 aa  61.2  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  39.24 
 
 
113 aa  61.2  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  37.35 
 
 
108 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  36.27 
 
 
141 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  37.93 
 
 
105 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.26 
 
 
627 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.11 
 
 
611 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  38.96 
 
 
105 aa  59.7  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  34.38 
 
 
108 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  37.8 
 
 
108 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  29.13 
 
 
110 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  34.31 
 
 
105 aa  58.9  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  28.85 
 
 
106 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  33 
 
 
617 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  33.33 
 
 
106 aa  58.9  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.86 
 
 
602 aa  58.9  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  29.13 
 
 
110 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  34.78 
 
 
107 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  34.44 
 
 
106 aa  58.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  30.1 
 
 
106 aa  58.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  28.16 
 
 
109 aa  58.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  32.26 
 
 
368 aa  58.2  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  32.61 
 
 
106 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  30.06 
 
 
608 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  31.52 
 
 
106 aa  57.8  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  34.48 
 
 
119 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  30.11 
 
 
627 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.02 
 
 
567 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  30.1 
 
 
110 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.91 
 
 
567 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.91 
 
 
567 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  34.12 
 
 
107 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  35.63 
 
 
101 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  35.21 
 
 
106 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  36.14 
 
 
102 aa  57.4  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.91 
 
 
567 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1719  thioredoxin  35.63 
 
 
102 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00129431  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.91 
 
 
567 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  34.94 
 
 
104 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  28.16 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01200  thioredoxin (trx), putative  26.47 
 
 
138 aa  56.6  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954839  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  34.94 
 
 
104 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  33.71 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  33.01 
 
 
141 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  28.16 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  32.94 
 
 
289 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  28.16 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  34.12 
 
 
107 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  35.56 
 
 
100 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  32.71 
 
 
106 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  28.16 
 
 
110 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  31.65 
 
 
106 aa  57  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  30.84 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  35.64 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  28.16 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  28.16 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  33.75 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  28.16 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  32.58 
 
 
109 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  32.94 
 
 
289 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  28.16 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  34.44 
 
 
98 aa  57  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1825  Thioredoxin domain protein  29.09 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  29.13 
 
 
108 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>