More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01200 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC01200  thioredoxin (trx), putative  100 
 
 		 138 aa  285  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954839  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  36.57 
 
 		 310 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  34.17 
 
 		 305 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  39.81 
 
 		 290 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  38.54 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  39.42 
 
 		 282 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  32.79 
 
 		 306 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  37.72 
 
 		 301 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  38.46 
 
 		 282 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  35.92 
 
 		 287 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  37.62 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  35.58 
 
 		 235 aa  84.3  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  37.86 
 
 		 106 aa  84.3  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  34.95 
 
 		 285 aa  84.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  37.5 
 
 		 282 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  35.11 
 
 		 268 aa  84  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  37.5 
 
 		 282 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  31.97 
 
 		 306 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  37.5 
 
 		 282 aa  83.6  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  31.97 
 
 		 306 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  38.83 
 
 		 290 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  36.54 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  36.54 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  38.46 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  35.24 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  34.86 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  36.54 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  41.38 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  34.91 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  34.58 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  34.95 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  37.5 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  39.36 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  37.5 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  38.38 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  37.72 
 
 		 918 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  33.98 
 
 		 324 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  40 
 
 		 277 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  35.58 
 
 		 282 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  36.89 
 
 		 280 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  37.86 
 
 		 290 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  35.58 
 
 		 282 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  37.23 
 
 		 271 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34.95 
 
 		 287 aa  80.9  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  32.71 
 
 		 330 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  35.58 
 
 		 282 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  37.86 
 
 		 290 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  37.86 
 
 		 290 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  37 
 
 		 281 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  37.23 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  41.25 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  36 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  33.01 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  36.19 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  38.24 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  33.63 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  36.78 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  31.78 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  36.63 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  37 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  32.69 
 
 		 324 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  42.05 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  36.11 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  33.65 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  31.37 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  35.92 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  41.25 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  32.35 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  35.24 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  34.95 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  41.25 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  34.95 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  40.78 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  35.58 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  33.33 
 
 		 326 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  33.02 
 
 		 282 aa  78.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  35.58 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  37.86 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  40.78 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  32.38 
 
 		 317 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  40.78 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  40.78 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  40.78 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  40.78 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  40.23 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  40.78 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  37.5 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  31.73 
 
 		 329 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  34.58 
 
 		 315 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  39.42 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  34.62 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>