More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0227 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0227  thioredoxin-related  100 
 
 		 130 aa  276  8e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1859  thioredoxin  44.19 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.263827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1934  Thioredoxin domain protein  37.21 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0815  thioredoxin-related  37.69 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221245  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  35.58 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  32.69 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  31.73 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  31.19 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  33.02 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  33.03 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  32.11 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  31.73 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  35.48 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  35.48 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  33.02 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  33.94 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  33.03 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  29.7 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  34.69 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  28.44 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  30.84 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  34.31 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  31.07 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  32 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  30.84 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  30.84 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  31.31 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  27.88 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  29 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  30.3 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  28.7 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  33.03 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  33.03 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  32 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  27.52 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  30.77 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  30.69 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  32.67 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  32.04 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  29.59 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  32 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  29.7 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  32.67 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  34.48 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  31.13 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  30.69 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  28.7 
 
 		 289 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  30.69 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  28.7 
 
 		 289 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  32.41 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  30.1 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  31.31 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  35.71 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  29.41 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  28.43 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  31 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  34.41 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  29.41 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  32.56 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  30.19 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  28.71 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  32 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  34.31 
 
 		 406 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  30.95 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  32.67 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  29.91 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  29.91 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  23.85 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  28.16 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  30.19 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  36.36 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  28.28 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  31.31 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  27.93 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  28.97 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  31 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  34.09 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  28.16 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  29.91 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  29.91 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  28.97 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  29.89 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  28.97 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  29.91 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  28.97 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  30.39 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  29.91 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  29.47 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  28.97 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  29.91 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  32.67 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  28.97 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  29.91 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  29.91 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3380  thioredoxin  36.59 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000757275  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  29.91 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>