More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0815 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0815  thioredoxin-related  100 
 
 		 130 aa  272  9e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221245  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1859  thioredoxin  41.09 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.263827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1934  Thioredoxin domain protein  37.5 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0227  thioredoxin-related  37.69 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  40.19 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  36.27 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  34.34 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  36.08 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  36.08 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  38.64 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  33.03 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  34.69 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  33.66 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  36.63 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  35.78 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  34.69 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  35.05 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  35.05 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.66 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  33.66 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  35.05 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  33.67 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  33.66 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  35.05 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  33.66 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  34.65 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  33.96 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  33.01 
 
 		 257 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  31.73 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  35.05 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  28.3 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  33.98 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  34.69 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  32.65 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  31.73 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  27.36 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  33.94 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  32.04 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  32.32 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  33.7 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  31.31 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  38.38 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  29.17 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  31.31 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  31.37 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  33.67 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  32.08 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  32.38 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  31.19 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  30.19 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  29.59 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  32 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  31.43 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  28.18 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  29.52 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  30.61 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  30.61 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  31.63 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  30.61 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  30.61 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  30.61 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  26.73 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  31.31 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  32.04 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  32.14 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  30.61 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  34.78 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  32.04 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  28.57 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  28.57 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  27.88 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  29.25 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  31.43 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  30.69 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  32.95 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  31.58 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  27.55 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  31.63 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  32.26 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  32.67 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  29.91 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  31.58 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  27.72 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  34.95 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  31.68 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  27.88 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  29.52 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  34.48 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  31.68 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>