More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0233 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0233  thioredoxin 1  100 
 
 		 105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.362513  normal  0.185715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  46.15 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  45.92 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  46.15 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  40.43 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  44.19 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  45.92 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  42.55 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  45 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  45 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  41.49 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  45 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  41.49 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  41.49 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  41.49 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  42.55 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  45.35 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  45.35 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  45.35 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  45.35 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  40.43 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  48.39 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  46.07 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  46.07 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  48.39 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  48.39 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  40.2 
 
 		 109 aa  93.6  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  43 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  43.88 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  40.43 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  44.9 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  43.33 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  41.76 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  45.56 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  43.33 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  40.43 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  41.94 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  43.33 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  43.33 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  40.43 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  37.14 
 
 		 108 aa  91.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  43 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  44.79 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  43 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  40.43 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  43.53 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  39.05 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  39.78 
 
 		 108 aa  90.9  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  39.36 
 
 		 108 aa  90.5  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  39.36 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  42 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  48.19 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  39.36 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  39.36 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  43.53 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  38.1 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  40.43 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  40.21 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  42.53 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  44.9 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  39.13 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  43.33 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  41.76 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  40.45 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>