More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0813 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  100 
 
 		 109 aa  223  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  35.63 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  34.12 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  32.94 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  33.73 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  30.59 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  32.56 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  30.59 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  31.4 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  35.63 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  31.4 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  31.76 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  30 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  30.59 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  35.9 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  30.59 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  34.15 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  32.56 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  29.76 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  31.4 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  28.24 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  40.68 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  29.41 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  31.4 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  31.76 
 
 		 406 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  36.36 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  27.06 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1719  thioredoxin  32.05 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00129431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  28.74 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  31.46 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  29.07 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  35.71 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  33.77 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  28.24 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  32.94 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0945  thioredoxin domain-containing protein  45 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  27.06 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  26.67 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  26.09 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  32.05 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  34.29 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  28.24 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  28.24 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  27.06 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  32.53 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  29.41 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  28.57 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  26.88 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  32.39 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  30.59 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  28.24 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  31.82 
 
 		 338 aa  60.5  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  29.41 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  31.76 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  24.71 
 
 		 268 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  30.59 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  28.74 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  28.28 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  30.59 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  34.52 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  28.28 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  38.96 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  30.59 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  30.59 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  35.06 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  29.41 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  29.41 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  29.41 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  25.88 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  29.41 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  27.06 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  31.17 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  29.41 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  32.47 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  28.24 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  25.88 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  31.82 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  28.74 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>