More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3396 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  100 
 
 		 104 aa  216  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  39.22 
 
 		 108 aa  93.2  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  36.73 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  37.76 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  38.78 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  47.5 
 
 		 285 aa  88.6  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  33.67 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  40.4 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  39.13 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  36.26 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  36.26 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  36.26 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  33.33 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  36.36 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  41.41 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  37.62 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  37 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  39.13 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  38.71 
 
 		 272 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  42.31 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  37.78 
 
 		 106 aa  84.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  43.18 
 
 		 302 aa  84.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  38 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  38.75 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  35.29 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  35.29 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  40.7 
 
 		 286 aa  84  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  31.68 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  39.76 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  37.37 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  35.42 
 
 		 102 aa  84  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  35.16 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  34.31 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  39.18 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  37.78 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  37.76 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  39.18 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  34 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  31.63 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  37.76 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  35.96 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  39.18 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  36.27 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  34.65 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  34.65 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  37.76 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  41.25 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  37.62 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  37.62 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  33.7 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  35.71 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  41.3 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  35.35 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  37.62 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  34 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  38.38 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  38.38 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  40.24 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  34.65 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  38.38 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  35.87 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  39.18 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  39.56 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  35 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  33 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  39.56 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  31.31 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  33.33 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  39.18 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  31.63 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  31.63 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  39.56 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  41.46 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  34.34 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  30.61 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  40.45 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  40.45 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  39.18 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  30.61 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  40.24 
 
 		 287 aa  80.5  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  37.76 
 
 		 178 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>