More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3887 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4009  redoxin domain-containing protein  98.1 
 
 
332 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0446  redoxin domain-containing protein  97.47 
 
 
316 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3887  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
316 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3813  Redoxin domain protein  97.7 
 
 
305 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0478  redoxin domain-containing protein  84.21 
 
 
306 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3552  redoxin domain-containing protein  84.21 
 
 
306 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0476  redoxin domain-containing protein  83.22 
 
 
306 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0994  hypothetical protein  35.28 
 
 
311 aa  232  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2714  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.9 
 
 
363 aa  162  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1064  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.95 
 
 
361 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.811729  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.05 
 
 
355 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.54 
 
 
188 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 
174 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  37.36 
 
 
173 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  31.17 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0940  periplasmic protein thiol/disulfide oxidoreductase DsbE  32.52 
 
 
185 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  31.17 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.97 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  28.32 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.78 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  31.82 
 
 
173 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  31.82 
 
 
173 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  30.52 
 
 
173 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  31.82 
 
 
173 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  30.71 
 
 
182 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.73 
 
 
183 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  27.78 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.62 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  31.17 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  34.19 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  31.17 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3536  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.82 
 
 
186 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  35.58 
 
 
181 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
167 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  36.11 
 
 
155 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  30.52 
 
 
173 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  31.75 
 
 
175 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  36.11 
 
 
155 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.16 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  27.15 
 
 
172 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  35.64 
 
 
191 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  36.11 
 
 
155 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  36.11 
 
 
155 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.99 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  26.54 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  26.54 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  30.52 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  26.54 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  26.54 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  26.54 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1889  thioredoxin family protein  27.91 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  32.38 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.45 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.31 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  35.09 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 
178 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  25.31 
 
 
191 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  25.47 
 
 
174 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.66 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  29.03 
 
 
174 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  33.66 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  36.36 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.87 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  34.58 
 
 
164 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.78 
 
 
187 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  30.84 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  29.52 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.3 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  28.47 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  28.93 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  28.19 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  29.36 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.58 
 
 
184 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3001  redoxin domain-containing protein  27.73 
 
 
196 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0287871  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  29.36 
 
 
160 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  38.04 
 
 
156 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  38.04 
 
 
165 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  34.65 
 
 
170 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3544  hypothetical protein  27.08 
 
 
199 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0341  redoxin domain-containing protein  27.78 
 
 
203 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  29.9 
 
 
173 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.72 
 
 
199 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  38.04 
 
 
165 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  29.47 
 
 
184 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  38.24 
 
 
171 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  29.47 
 
 
184 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  30.53 
 
 
184 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1789  Redoxin domain protein  37.25 
 
 
165 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  32.98 
 
 
167 aa  63.5  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  30.53 
 
 
184 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 
228 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.04 
 
 
169 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  30.53 
 
 
184 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  30.53 
 
 
184 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  30.53 
 
 
184 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.42 
 
 
179 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.63 
 
 
193 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  30.53 
 
 
184 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  32.35 
 
 
155 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.37 
 
 
206 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.787704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>