More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0350 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  220  4e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  52.88 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  50 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  41.75 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  40.95 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  40.82 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  42.27 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  41.41 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  40.4 
 
 		 104 aa  87  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  36.67 
 
 		 104 aa  87  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  36.54 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  40.19 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  42.42 
 
 		 106 aa  85.9  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  36.54 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  40.19 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  40.19 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  42.42 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  40.59 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  40.74 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  35.85 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  40.57 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  35.58 
 
 		 104 aa  84.3  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  40.74 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  40.74 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  44.33 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  39.62 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  41.05 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  42.42 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  39.62 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  40 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  38.68 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  38.68 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  38.46 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  43.3 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  40.86 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  41.86 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  42.22 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  45.16 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  34.65 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  39.22 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  41.11 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  38.38 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  41.75 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  38.78 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  40.38 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  40.78 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  36.79 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  38.2 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  37.96 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  37.25 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  35.64 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  36.89 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  40.38 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  42.17 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  45.33 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  40.38 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  39.08 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  38.32 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  38.32 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  39.53 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  41.86 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  40.45 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  38.32 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  38.32 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  38.32 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  38.32 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  39.08 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  37.04 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  41.86 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  39.53 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  38.32 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  38.3 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  39.53 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  39.77 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  33.98 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  40 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  37.93 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  36.54 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  38.54 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.78 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  39.58 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  38.32 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  35.85 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  39.33 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  38.89 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  37.04 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  37.04 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  36.11 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  37.04 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  37.04 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  37.38 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  37.04 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  37.38 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>