More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1908 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 128 aa  259  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3604  thioredoxin domain-containing protein  56.91 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  52.76 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2781  thioredoxin  67.82 
 
 		 87 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.528601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4016  thioredoxin domain protein  51.16 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1025  thioredoxin-related  39.84 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  43.22 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  46.15 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  48.35 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  48.35 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3645  thioredoxin domain-containing protein  48.28 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.890766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1087  Thioredoxin domain protein  49.43 
 
 		 129 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.826113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  47.25 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4059  thioredoxin domain-containing protein  48.81 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.653805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  40.52 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1217  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  41.57 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  41.57 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  36.14 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  41.57 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  40.86 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  37.36 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  37.36 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  37.36 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  40.86 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  39.33 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  41.46 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  41.18 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  38.27 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  38.27 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  39.36 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  35.37 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  35.71 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  40.91 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  37.63 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  42.17 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  39 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  40.7 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  35.37 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  37.04 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  44.16 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  32.53 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  41.77 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  34.48 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  39.53 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  33.73 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  35.8 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  40.74 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  40.66 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  38.37 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  37.04 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  35.8 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  37.5 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  40.48 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  37.5 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  34.48 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  38.37 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  33.73 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  38.37 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  37.5 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  38.37 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  34.07 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  38.04 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  35.63 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  35.63 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  37.5 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  35.35 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  38.1 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  41.57 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  37.65 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  37.21 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  37.63 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  35.29 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  34.12 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  37.23 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  34.57 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  39.51 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  33.77 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  34.57 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  30.77 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  36.14 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>