More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3325 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 176 aa  358  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  43.3 
 
 		 110 aa  99  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  39.58 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  36.54 
 
 		 290 aa  92  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  43.96 
 
 		 149 aa  90.9  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  44.57 
 
 		 107 aa  90.9  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  40.43 
 
 		 109 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  40.43 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  42.55 
 
 		 235 aa  89.4  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  33.68 
 
 		 102 aa  89  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  43.81 
 
 		 293 aa  89  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  34.62 
 
 		 223 aa  88.6  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  36.84 
 
 		 109 aa  87.8  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  35.58 
 
 		 290 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  34.45 
 
 		 330 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  43.33 
 
 		 106 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  37.89 
 
 		 326 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  40.78 
 
 		 287 aa  86.3  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  39.18 
 
 		 113 aa  85.9  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  38.14 
 
 		 106 aa  85.9  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  42.17 
 
 		 107 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  36.46 
 
 		 109 aa  85.9  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  42.86 
 
 		 259 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  44.05 
 
 		 113 aa  85.5  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  36.89 
 
 		 107 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  42.86 
 
 		 293 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  41.57 
 
 		 280 aa  85.1  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  36.73 
 
 		 133 aa  85.1  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  43.21 
 
 		 107 aa  84.7  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  33.67 
 
 		 107 aa  84.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  33.67 
 
 		 107 aa  84.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  33.67 
 
 		 107 aa  84.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  40.7 
 
 		 109 aa  84.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  33.67 
 
 		 107 aa  84.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  36.36 
 
 		 110 aa  84.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  36.89 
 
 		 107 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  36.21 
 
 		 269 aa  84  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  43.01 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  34.95 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  40 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  32.65 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  41.11 
 
 		 106 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  35.56 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  40.51 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  34.74 
 
 		 109 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  41.11 
 
 		 106 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  35.96 
 
 		 109 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  34.95 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  32.65 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  37.65 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  37.89 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  35.11 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  37.5 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  41.94 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  41.94 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  34.69 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  37.35 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  41.94 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  34.02 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  40.48 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  37.86 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  38.89 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  34 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  37.23 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  37.36 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  35.48 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  37.11 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  31.25 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  35.04 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  34.44 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  32.65 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  37.62 
 
 		 302 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  34.83 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  34.83 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  34.83 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  33.98 
 
 		 290 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  38.2 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  41.1 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  33.72 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  38.1 
 
 		 406 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  38.54 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  37.5 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  34.74 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  39.53 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  35.56 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.63 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  42.68 
 
 		 289 aa  80.9  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  42.68 
 
 		 289 aa  80.9  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  40 
 
 		 281 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  35.56 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  35.56 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  32.63 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  41.25 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  36.84 
 
 		 315 aa  80.9  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  40.43 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  31.36 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  35.56 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>