More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2886 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  271  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3604  thioredoxin domain-containing protein  67.01 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  61.7 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2781  thioredoxin  66.28 
 
 		 87 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.528601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  47.75 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  47.97 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1025  thioredoxin-related  58.14 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3645  thioredoxin domain-containing protein  55.43 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.890766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4059  thioredoxin domain-containing protein  47.54 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.653805  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  49.11 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  51.02 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4016  thioredoxin domain protein  55.29 
 
 		 140 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1087  Thioredoxin domain protein  56.98 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.826113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  52.22 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 130 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  41.07 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1217  Thioredoxin domain protein  36.28 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  43.9 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  41.76 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  42.86 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  37.36 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  38.46 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  45.45 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  42.35 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  42.35 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  43.42 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  43.42 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  43.42 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  42.35 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  40.48 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  37.21 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  38.55 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  40.7 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  42.68 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  42.68 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  34.74 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  42.17 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  42.68 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  42.17 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  39.24 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  37.5 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  44.16 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  37.5 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  44.16 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  41.38 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  41.46 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  41.38 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  45.57 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  42.86 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  38.55 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  40.74 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  42.17 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  41.46 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  35.58 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  38.1 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  38.1 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  42.17 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  41.98 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  44.3 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  38.55 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  40.24 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  39.29 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  40.24 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  38.96 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  38.37 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  37.8 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  39.24 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  36.9 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  37.8 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  37.8 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  40.96 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  42.68 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  38.37 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  39.51 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  39.76 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  38.37 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  37.35 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  38.37 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  37.8 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  37.8 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  37.8 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  37.21 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>