More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1217 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1217  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1651  hypothetical protein  35.29 
 
 		 171 aa  108  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000147979  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0173  hypothetical protein  39.69 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 130 aa  97.1  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  35.48 
 
 		 125 aa  91.3  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3604  thioredoxin domain-containing protein  37.72 
 
 		 127 aa  84.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  50.72 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  50 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  46.75 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  36.28 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2781  thioredoxin  37.61 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.528601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3645  thioredoxin domain-containing protein  35.96 
 
 		 135 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.890766 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  47.83 
 
 		 125 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1025  thioredoxin-related  46.97 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1087  Thioredoxin domain protein  46.97 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.826113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4016  thioredoxin domain protein  34.86 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4059  thioredoxin domain-containing protein  52.46 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.653805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  41.79 
 
 		 127 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  40.54 
 
 		 700 aa  58.9  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  39.19 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  37.84 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  39.19 
 
 		 105 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  39.74 
 
 		 104 aa  57.4  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  39.19 
 
 		 105 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  48.21 
 
 		 106 aa  57.4  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  31.67 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  37.65 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2862  hypothetical protein  26.95 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.816123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  36.47 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  38.89 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  41.54 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  31.91 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  41.67 
 
 		 102 aa  54.3  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  37.08 
 
 		 110 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  35.14 
 
 		 107 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  40.51 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  41.94 
 
 		 102 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  40.85 
 
 		 105 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  40.26 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2547  hypothetical protein  26.51 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2110  thioredoxin  36.59 
 
 		 107 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000269278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  35.53 
 
 		 110 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2283  thioredoxin  27.1 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000888091  normal  0.229948 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  35.8 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  39.74 
 
 		 103 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1719  thioredoxin  38.71 
 
 		 102 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00129431  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  34.69 
 
 		 119 aa  52  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  42.65 
 
 		 141 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  39.51 
 
 		 115 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  42.19 
 
 		 107 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  42.19 
 
 		 107 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  40.85 
 
 		 105 aa  52  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  36.14 
 
 		 299 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  41.67 
 
 		 287 aa  51.6  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  52  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  41.67 
 
 		 105 aa  51.6  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  32.35 
 
 		 918 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  37.5 
 
 		 105 aa  51.2  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  37.18 
 
 		 110 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  35.29 
 
 		 109 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  35.29 
 
 		 109 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  31.65 
 
 		 98 aa  51.6  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  35.29 
 
 		 109 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  39.34 
 
 		 268 aa  51.2  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  37.5 
 
 		 109 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  32.94 
 
 		 330 aa  51.2  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  37.97 
 
 		 286 aa  50.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  37.33 
 
 		 259 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  38.57 
 
 		 106 aa  50.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  36.67 
 
 		 107 aa  51.2  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  38.57 
 
 		 302 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  40.68 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  40.62 
 
 		 119 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2577  thioredoxin  27.45 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09641  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  41.67 
 
 		 337 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  42.19 
 
 		 107 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  40.3 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  34.12 
 
 		 120 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  50.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  40.62 
 
 		 106 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  31.48 
 
 		 108 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  35 
 
 		 300 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  40.62 
 
 		 106 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  38.89 
 
 		 109 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  31.71 
 
 		 109 aa  50.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  34.72 
 
 		 105 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  38.57 
 
 		 302 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  32.89 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  38.33 
 
 		 109 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  36.84 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  36.99 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  36.51 
 
 		 98 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  43.86 
 
 		 108 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  36.71 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 301 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  37.14 
 
 		 302 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>