104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2513 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  700    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  36.96 
 
 
352 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  37.64 
 
 
409 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  33.2 
 
 
638 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  31.76 
 
 
641 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.7 
 
 
458 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  33.77 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  33.12 
 
 
570 aa  91.3  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  32.57 
 
 
471 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  39.56 
 
 
505 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  35.62 
 
 
1200 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  40.66 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.36 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.36 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  27.36 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  35.96 
 
 
735 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  27.03 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  30.11 
 
 
871 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  27 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  31.08 
 
 
648 aa  73.2  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  34.69 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  34.53 
 
 
1001 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.32 
 
 
510 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  31.71 
 
 
500 aa  66.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  26.12 
 
 
432 aa  66.2  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  28.09 
 
 
940 aa  65.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  30.96 
 
 
564 aa  66.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  26.01 
 
 
501 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  25.57 
 
 
422 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  30.43 
 
 
707 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  28.65 
 
 
308 aa  63.2  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  24.08 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  43.75 
 
 
550 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.95 
 
 
425 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  28.31 
 
 
899 aa  60.5  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  24.39 
 
 
428 aa  60.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  26.32 
 
 
647 aa  60.1  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  20.68 
 
 
459 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  32 
 
 
153 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  22.71 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.4 
 
 
458 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  39.53 
 
 
525 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  27.32 
 
 
635 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  23.55 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  23.55 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  32.09 
 
 
172 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  20.96 
 
 
458 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  24.32 
 
 
483 aa  57.4  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  24.22 
 
 
437 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  25.41 
 
 
503 aa  57  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  20.77 
 
 
459 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.7 
 
 
467 aa  56.2  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  21.32 
 
 
457 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  25.82 
 
 
410 aa  55.1  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  26.96 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  27.39 
 
 
671 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  28.71 
 
 
1025 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  23.15 
 
 
442 aa  53.5  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  22.37 
 
 
451 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.64 
 
 
2272 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  25.13 
 
 
2036 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  25.67 
 
 
1969 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  29.95 
 
 
831 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.78 
 
 
467 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  20.13 
 
 
443 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  22.31 
 
 
431 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  24.81 
 
 
429 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  24.37 
 
 
406 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.58 
 
 
447 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  28.52 
 
 
595 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  22.03 
 
 
429 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  21.61 
 
 
439 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  20.39 
 
 
454 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.68 
 
 
464 aa  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  26.67 
 
 
768 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.68 
 
 
464 aa  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  26.64 
 
 
418 aa  49.7  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  26.05 
 
 
960 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  21.09 
 
 
429 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  21.38 
 
 
505 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  21.03 
 
 
454 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  27.84 
 
 
1092 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  21.43 
 
 
424 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  23.19 
 
 
441 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  28.02 
 
 
820 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  28.04 
 
 
892 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.11 
 
 
424 aa  46.2  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.84 
 
 
425 aa  46.2  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  30.77 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  21.62 
 
 
452 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.93 
 
 
594 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  22.22 
 
 
428 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  23.56 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  21.13 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  28.63 
 
 
863 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  21.13 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.55 
 
 
685 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  21.09 
 
 
462 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  37.5 
 
 
810 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  22.66 
 
 
674 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>