116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1075 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 442 aa  905    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  53.68 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  45.94 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  50.39 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  48.99 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  48.77 
 
 		 428 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  46.84 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  42.4 
 
 		 467 aa  359  5e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  46.12 
 
 		 439 aa  348  8e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  41.69 
 
 		 410 aa  330  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  41.2 
 
 		 454 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  41.36 
 
 		 454 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  38.96 
 
 		 451 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  39.64 
 
 		 462 aa  315  9e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  40.97 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  40.97 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  41.48 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  40.4 
 
 		 431 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  40.37 
 
 		 432 aa  310  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  39.64 
 
 		 452 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  39.44 
 
 		 423 aa  306  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  39.44 
 
 		 423 aa  306  6e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  39.09 
 
 		 464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  39.09 
 
 		 464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  37.72 
 
 		 462 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  40.86 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  39.81 
 
 		 425 aa  299  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  39.11 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  36.93 
 
 		 446 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  37.67 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  37.5 
 
 		 429 aa  295  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  37.22 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  38.38 
 
 		 428 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  38.58 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  38.31 
 
 		 443 aa  286  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  38.07 
 
 		 429 aa  285  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  38.32 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  39.37 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  41.09 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  39.6 
 
 		 416 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  38.44 
 
 		 439 aa  280  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  37.47 
 
 		 422 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  39.36 
 
 		 416 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  39.36 
 
 		 416 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  39.01 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  39 
 
 		 400 aa  278  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  38.65 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  36.95 
 
 		 447 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  35.75 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 		 503 aa  227  4e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  32.89 
 
 		 501 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  32.26 
 
 		 454 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.3 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  31.27 
 
 		 417 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  30.21 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  28.86 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.65 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  29.58 
 
 		 405 aa  143  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  28.28 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  29.56 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  28.22 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  31.08 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.83 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.65 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  27.07 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  26.87 
 
 		 633 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.74 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  24.59 
 
 		 638 aa  99.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  25.89 
 
 		 1200 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  23.78 
 
 		 651 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  22.32 
 
 		 672 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  25.89 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  23.61 
 
 		 711 aa  72.8  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.59 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  23.27 
 
 		 648 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  24.68 
 
 		 641 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  22.89 
 
 		 1332 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  26.26 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  24.49 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.32 
 
 		 677 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  25.11 
 
 		 735 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  23.6 
 
 		 638 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  24.21 
 
 		 570 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1938  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.78 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  25.19 
 
 		 810 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  24.6 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  26.15 
 
 		 647 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  22.99 
 
 		 871 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  20.91 
 
 		 471 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.17 
 
 		 685 aa  53.9  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  27.09 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  28.28 
 
 		 505 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0578  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.51 
 
 		 364 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.56022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  27.54 
 
 		 707 aa  53.5  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28530  hypothetical protein  34.17 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0528408  normal  0.0603049 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  29.23 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  22 
 
 		 352 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  23.9 
 
 		 768 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  37.08 
 
 		 975 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>