89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1722 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  100 
 
 
711 aa  1389    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  48.83 
 
 
638 aa  521  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  42.75 
 
 
651 aa  462  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  38.76 
 
 
672 aa  437  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  40.09 
 
 
633 aa  412  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  26.6 
 
 
451 aa  97.4  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.2 
 
 
467 aa  95.1  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  23.96 
 
 
462 aa  93.6  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  26.3 
 
 
503 aa  93.2  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  25.51 
 
 
437 aa  92.8  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  27.23 
 
 
454 aa  91.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.42 
 
 
447 aa  91.3  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  25.06 
 
 
417 aa  87.8  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  26.03 
 
 
439 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  25.06 
 
 
443 aa  86.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.32 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  25.45 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  24.49 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  25.92 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  25.6 
 
 
428 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  25.74 
 
 
454 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  20.76 
 
 
441 aa  80.1  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  25.65 
 
 
452 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.04 
 
 
428 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.3 
 
 
459 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  21.41 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  23.72 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  23.06 
 
 
439 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28 
 
 
458 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  22.8 
 
 
462 aa  76.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  25 
 
 
422 aa  77  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  24.01 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  23.42 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  24.01 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  24.65 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  22.1 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  25 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  23 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  23 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  25.73 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.71 
 
 
458 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  28.21 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  23.97 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  20.47 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  19.86 
 
 
467 aa  70.9  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  23.17 
 
 
446 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  22.35 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  22.38 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.11 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.11 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  23.11 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  26.27 
 
 
400 aa  67  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  22.22 
 
 
410 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  22.12 
 
 
501 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  25.92 
 
 
416 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  23.43 
 
 
1200 aa  65.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  22.1 
 
 
431 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.67 
 
 
416 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.67 
 
 
416 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  22.37 
 
 
429 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  25.67 
 
 
400 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  19.28 
 
 
405 aa  62  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  20 
 
 
425 aa  61.2  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.47 
 
 
424 aa  58.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  21.58 
 
 
404 aa  58.2  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  23.83 
 
 
452 aa  57.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  18.65 
 
 
406 aa  56.6  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3862  3-dehydroshikimate dehydratase (DHS dehydratase) (DHSase)  28.63 
 
 
489 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  24.34 
 
 
424 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  23.86 
 
 
429 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  25.7 
 
 
422 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  22.22 
 
 
452 aa  53.9  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  23.27 
 
 
429 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  24.77 
 
 
570 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.22 
 
 
685 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4069  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.99 
 
 
490 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  22.96 
 
 
418 aa  49.7  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  22.1 
 
 
638 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  21.95 
 
 
648 aa  47.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.83 
 
 
677 aa  47.4  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  23.89 
 
 
422 aa  47.4  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0597  hypothetical protein  27.64 
 
 
161 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  36.99 
 
 
871 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.81 
 
 
510 aa  45.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  39.22 
 
 
163 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  39.22 
 
 
163 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  43.9 
 
 
152 aa  45.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  39.22 
 
 
163 aa  44.7  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  22.22 
 
 
1092 aa  43.9  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>