98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4345 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  82.85 
 
 
464 aa  770    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  82.85 
 
 
464 aa  770    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  100 
 
 
462 aa  944    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  54.89 
 
 
451 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  56.81 
 
 
454 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  52.99 
 
 
462 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  55.19 
 
 
452 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  57.41 
 
 
454 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  51.19 
 
 
443 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  49.39 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  49.76 
 
 
445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  41.78 
 
 
437 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  40.24 
 
 
442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  36.16 
 
 
441 aa  310  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.11 
 
 
428 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  38.86 
 
 
428 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  37.05 
 
 
483 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  37.23 
 
 
439 aa  286  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  35.75 
 
 
457 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  35.35 
 
 
410 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  34.99 
 
 
446 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  33.56 
 
 
467 aa  266  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  34.29 
 
 
432 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  33.04 
 
 
431 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  33.04 
 
 
431 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  32.8 
 
 
423 aa  253  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  32.8 
 
 
423 aa  253  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  32.73 
 
 
439 aa  250  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  34.41 
 
 
446 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  32.38 
 
 
429 aa  246  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  32.56 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  32.79 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  33.18 
 
 
416 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  33.18 
 
 
416 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  32.65 
 
 
425 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  32.94 
 
 
416 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  32.86 
 
 
400 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  32.36 
 
 
428 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  32.57 
 
 
422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  31.08 
 
 
431 aa  236  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  32.86 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  32.19 
 
 
424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  32.42 
 
 
429 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  31 
 
 
431 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  31.96 
 
 
429 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.1 
 
 
447 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  31.28 
 
 
428 aa  230  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  30.9 
 
 
424 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  29.46 
 
 
503 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  29.04 
 
 
452 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  29.18 
 
 
501 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.31 
 
 
467 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.42 
 
 
459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  27.8 
 
 
454 aa  166  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30 
 
 
458 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  27.66 
 
 
422 aa  143  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.77 
 
 
458 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  29.48 
 
 
459 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  25.64 
 
 
417 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  27.83 
 
 
452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  26.77 
 
 
410 aa  133  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  25.78 
 
 
405 aa  123  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  25.88 
 
 
418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  25.88 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.36 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.86 
 
 
425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  25.78 
 
 
638 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  22.82 
 
 
406 aa  103  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  23.82 
 
 
633 aa  92.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  23.32 
 
 
672 aa  70.9  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  22.8 
 
 
711 aa  70.1  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.93 
 
 
677 aa  68.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  26.64 
 
 
648 aa  68.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  23.81 
 
 
1200 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  21.96 
 
 
651 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  29.6 
 
 
2272 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  21.23 
 
 
871 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  26.05 
 
 
1969 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  26.49 
 
 
707 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  31.33 
 
 
172 aa  53.9  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  26.23 
 
 
2036 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  23.53 
 
 
768 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  22.95 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  24.88 
 
 
375 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  25.79 
 
 
1025 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0578  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.79 
 
 
364 aa  52  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.56022  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1938  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.19 
 
 
369 aa  50.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  30.07 
 
 
308 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  26.4 
 
 
341 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.67 
 
 
510 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29690  hypothetical protein  27.82 
 
 
348 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388142  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  23.44 
 
 
641 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  21.49 
 
 
352 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.33 
 
 
685 aa  43.9  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  21.1 
 
 
735 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  25.12 
 
 
647 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  23.61 
 
 
1092 aa  43.5  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  31.3 
 
 
1332 aa  43.1  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>