120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0787 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  100 
 
 		 647 aa  1294    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.6 
 
 		 685 aa  114  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.04 
 
 		 677 aa  103  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  27.62 
 
 		 570 aa  101  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  24.35 
 
 		 638 aa  91.3  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  25.96 
 
 		 1200 aa  88.6  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  25.15 
 
 		 641 aa  79  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.53 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1001 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  33.56 
 
 		 1332 aa  73.9  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  34.1 
 
 		 707 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  31.22 
 
 		 899 aa  70.1  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  24.76 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  26.19 
 
 		 1931 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.85 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  32.12 
 
 		 810 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  26.96 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  27.07 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.92 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.16 
 
 		 416 aa  67  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.16 
 
 		 416 aa  67  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  25.16 
 
 		 400 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  25.08 
 
 		 400 aa  67  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  26.39 
 
 		 428 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  24.84 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  21.47 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.92 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  25.49 
 
 		 400 aa  63.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  28.64 
 
 		 871 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  24.92 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  26.25 
 
 		 831 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  32.39 
 
 		 2272 aa  61.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  34.92 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  27.56 
 
 		 805 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  29.33 
 
 		 892 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  25.63 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  25.75 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  29.33 
 
 		 820 aa  60.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  23.59 
 
 		 459 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.63 
 
 		 428 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.55 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  24.66 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  24.66 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  28.03 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  21.88 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  24.24 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  25.65 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  25.75 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  27.54 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  22.71 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  28.72 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  23.98 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  25.52 
 
 		 940 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  32.86 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  24.8 
 
 		 423 aa  57  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  27.27 
 
 		 365 aa  56.6  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  26.22 
 
 		 153 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  23.91 
 
 		 443 aa  56.6  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.57 
 
 		 735 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  26.15 
 
 		 442 aa  55.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  25.12 
 
 		 439 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  26.23 
 
 		 595 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  28.66 
 
 		 375 aa  55.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  23.4 
 
 		 483 aa  55.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  23.03 
 
 		 437 aa  55.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  22.15 
 
 		 423 aa  55.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  22.15 
 
 		 423 aa  55.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  25.41 
 
 		 509 aa  55.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  26.18 
 
 		 972 aa  54.3  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  25.83 
 
 		 960 aa  53.9  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.26 
 
 		 425 aa  54.3  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.93 
 
 		 594 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  32.62 
 
 		 1969 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  23.98 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  24.38 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  22.47 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  23.98 
 
 		 431 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  32.62 
 
 		 2036 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  24.88 
 
 		 308 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  25.41 
 
 		 1056 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  25.63 
 
 		 674 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  24.09 
 
 		 454 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  22.76 
 
 		 425 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  22.15 
 
 		 462 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  24.17 
 
 		 451 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  26.7 
 
 		 5453 aa  51.2  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  26.55 
 
 		 441 aa  51.2  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 1121 aa  50.8  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  30.06 
 
 		 172 aa  50.8  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.06 
 
 		 467 aa  50.4  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.96 
 
 		 424 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  26.54 
 
 		 635 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  25.08 
 
 		 500 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  21.34 
 
 		 446 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  24.79 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  25.96 
 
 		 341 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  23.73 
 
 		 863 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  32.72 
 
 		 505 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  22.47 
 
 		 505 aa  48.5  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  23.44 
 
 		 418 aa  47.4  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>