101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2860 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 451 aa  911    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  61.95 
 
 		 462 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  62.09 
 
 		 454 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  55.33 
 
 		 462 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  56.68 
 
 		 464 aa  519  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  58.8 
 
 		 452 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  56.68 
 
 		 464 aa  519  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  61.34 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  50.82 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  47.17 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  47.36 
 
 		 445 aa  398  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  40.79 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  39.39 
 
 		 442 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  39.17 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.8 
 
 		 428 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  35.38 
 
 		 441 aa  296  6e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  41.33 
 
 		 439 aa  296  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  36.08 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  35.39 
 
 		 483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  33.33 
 
 		 467 aa  276  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  36.55 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  35.99 
 
 		 446 aa  256  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  33.99 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  33.94 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  34.67 
 
 		 410 aa  250  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  34.54 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.62 
 
 		 424 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  34.4 
 
 		 423 aa  246  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  34.4 
 
 		 423 aa  246  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  33.41 
 
 		 431 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  33.1 
 
 		 424 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  34.39 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  33.26 
 
 		 431 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  33.26 
 
 		 431 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  32.13 
 
 		 429 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  32.13 
 
 		 429 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  33.48 
 
 		 425 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  33.18 
 
 		 429 aa  230  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  33.99 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  33.99 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  33.25 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  34.13 
 
 		 447 aa  227  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  33.74 
 
 		 416 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  33.74 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  32.32 
 
 		 423 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  33.25 
 
 		 400 aa  223  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  31.67 
 
 		 428 aa  219  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  33.33 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  31.87 
 
 		 452 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  31.68 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  29.03 
 
 		 501 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.03 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.9 
 
 		 459 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  27.46 
 
 		 454 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  31.54 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.68 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.09 
 
 		 458 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  27.42 
 
 		 422 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  25.48 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  27.55 
 
 		 452 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  27.46 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  22.91 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  24.13 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  25.88 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  25.12 
 
 		 404 aa  110  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.46 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.24 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  25.81 
 
 		 633 aa  106  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  27.08 
 
 		 638 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  25.86 
 
 		 711 aa  94  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  24.41 
 
 		 651 aa  86.7  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  24.84 
 
 		 672 aa  81.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  23.98 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  29.37 
 
 		 1200 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  26.83 
 
 		 641 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  25.46 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  31.08 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  23.9 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  22.78 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  22.83 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  22.58 
 
 		 647 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  29.52 
 
 		 899 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  24.42 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  23.31 
 
 		 638 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  25.12 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  23.53 
 
 		 735 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  27.52 
 
 		 153 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.68 
 
 		 677 aa  47.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  24.72 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  31.52 
 
 		 302 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  24.14 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2988  stress protein  31.78 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  24.63 
 
 		 871 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  29.36 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.23 
 
 		 685 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7282  hypothetical protein  29.38 
 
 		 867 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.827215  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.46 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  25.65 
 
 		 707 aa  44.3  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3628  hypothetical protein  30.53 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1001 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>