94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4470 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 446 aa  914    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  75.62 
 
 		 446 aa  666    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  68.08 
 
 		 410 aa  571  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  56.09 
 
 		 439 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  56.04 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  53.88 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  53.32 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  54.2 
 
 		 447 aa  438  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  51.81 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  51.21 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  51.94 
 
 		 424 aa  428  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  51.54 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  51.87 
 
 		 424 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  46.88 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  42.61 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  40.05 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  40 
 
 		 483 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  38.39 
 
 		 467 aa  319  7e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  41.46 
 
 		 437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  38.46 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  37.34 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.07 
 
 		 428 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  38.07 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  36.12 
 
 		 454 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  37.38 
 
 		 454 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  35.76 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  35.48 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  34.41 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.93 
 
 		 464 aa  249  7e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.93 
 
 		 464 aa  249  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  34.77 
 
 		 439 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  33.03 
 
 		 462 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  34.53 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  34.09 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  36.83 
 
 		 445 aa  229  8e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  33.92 
 
 		 416 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  33.92 
 
 		 416 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  33.92 
 
 		 416 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  32.35 
 
 		 400 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  30.47 
 
 		 423 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  30.55 
 
 		 431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  30.55 
 
 		 431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  30.47 
 
 		 423 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  30.2 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  30.66 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  30.17 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  31.3 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  30.89 
 
 		 432 aa  204  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  30.92 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  29.32 
 
 		 503 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  28.17 
 
 		 501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.86 
 
 		 467 aa  153  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  27.64 
 
 		 417 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  26.99 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  26.77 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  30.1 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  26.13 
 
 		 404 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.7 
 
 		 458 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  26.09 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.09 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.13 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  23.85 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  24.63 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  26.94 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  24.82 
 
 		 633 aa  94.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  25.06 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.57 
 
 		 425 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.53 
 
 		 425 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  23.08 
 
 		 638 aa  86.3  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  22.47 
 
 		 672 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  23.5 
 
 		 711 aa  76.6  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  23.43 
 
 		 651 aa  73.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  25.63 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  23.14 
 
 		 1200 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.11 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  25.19 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  27.22 
 
 		 899 aa  55.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  33.33 
 
 		 1332 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  26.35 
 
 		 172 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  19.93 
 
 		 471 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  20.2 
 
 		 648 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  24.12 
 
 		 1025 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  24.07 
 
 		 940 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  25.98 
 
 		 1092 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  29.94 
 
 		 1755 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  22.17 
 
 		 831 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.88 
 
 		 685 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  26.86 
 
 		 724 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  25.83 
 
 		 564 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.69 
 
 		 677 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  23.62 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  25.19 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  21.95 
 
 		 308 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  24.9 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>