146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1833 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 595 aa  1171    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  30.58 
 
 		 1056 aa  196  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  27.89 
 
 		 1931 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  35.14 
 
 		 940 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.78 
 
 		 777 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 1121 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  47.17 
 
 		 1035 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  32.92 
 
 		 641 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  43.93 
 
 		 838 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  34.69 
 
 		 471 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  26.88 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  26.48 
 
 		 954 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  33.56 
 
 		 871 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  26.67 
 
 		 831 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  42.6 
 
 		 735 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  37 
 
 		 461 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  36.31 
 
 		 1092 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  28.83 
 
 		 805 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.94 
 
 		 614 aa  103  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  36.42 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  32.09 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  36.96 
 
 		 749 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  35.57 
 
 		 505 aa  97.8  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  35.18 
 
 		 245 aa  97.8  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  32.78 
 
 		 810 aa  97.1  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  24.72 
 
 		 892 aa  97.1  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  25.17 
 
 		 820 aa  94.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  35.75 
 
 		 547 aa  91.3  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  48.91 
 
 		 522 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  30.8 
 
 		 635 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  33.48 
 
 		 724 aa  88.2  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  31.11 
 
 		 697 aa  87  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  29.04 
 
 		 698 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1001 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  36.94 
 
 		 620 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  29.17 
 
 		 810 aa  80.9  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  29.83 
 
 		 960 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  51.47 
 
 		 488 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  41.57 
 
 		 579 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  32.14 
 
 		 709 aa  79  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.79 
 
 		 547 aa  77  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  24.77 
 
 		 638 aa  74.3  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  50.72 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  26.02 
 
 		 720 aa  74.3  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  51.52 
 
 		 739 aa  74.3  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  30.06 
 
 		 1628 aa  73.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  36.3 
 
 		 297 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  51.43 
 
 		 787 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  47.76 
 
 		 831 aa  73.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.08 
 
 		 594 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  51.52 
 
 		 581 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  44.59 
 
 		 479 aa  72  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  47.3 
 
 		 930 aa  71.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  33.59 
 
 		 919 aa  71.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  35.43 
 
 		 958 aa  70.9  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  41.86 
 
 		 676 aa  70.5  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  47.22 
 
 		 735 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  27.94 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  55.56 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.94 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.94 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  43.75 
 
 		 869 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  48.57 
 
 		 848 aa  68.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  32.66 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  40.45 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  27.94 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  28.25 
 
 		 1025 aa  68.2  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  49.21 
 
 		 387 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  40.43 
 
 		 668 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  47.3 
 
 		 627 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.12 
 
 		 746 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.87 
 
 		 677 aa  63.9  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  52.54 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  49.21 
 
 		 887 aa  63.9  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  25 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  31.93 
 
 		 570 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  49.15 
 
 		 294 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  23.23 
 
 		 483 aa  62  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  25.44 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  25.44 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  24.44 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  47.62 
 
 		 883 aa  61.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  43.06 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  35.42 
 
 		 528 aa  60.5  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  24.56 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  27.41 
 
 		 352 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  25.1 
 
 		 400 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  47.62 
 
 		 884 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  39.74 
 
 		 389 aa  60.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  32.52 
 
 		 707 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3133  hypothetical protein  34.01 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.717287  normal  0.669821 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  27.21 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  21.74 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.58 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7282  hypothetical protein  29.58 
 
 		 867 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.827215  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  45.76 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  43.28 
 
 		 110 aa  57.4  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  37.93 
 
 		 403 aa  57  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  30.62 
 
 		 1200 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  50.94 
 
 		 343 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>