139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2324 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  94.4 
 
 
416 aa  747    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  94.25 
 
 
400 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  100 
 
 
400 aa  806    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  94.91 
 
 
416 aa  750    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  94.91 
 
 
416 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  67.09 
 
 
432 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  65.41 
 
 
422 aa  541  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  63.34 
 
 
423 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  63.34 
 
 
423 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  61.39 
 
 
431 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  61.39 
 
 
431 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  61.83 
 
 
428 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  59.61 
 
 
423 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  61.48 
 
 
400 aa  492  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  59.51 
 
 
425 aa  492  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  38.59 
 
 
442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  37.03 
 
 
441 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  37.77 
 
 
437 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  35.88 
 
 
483 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  38.2 
 
 
439 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  36.56 
 
 
457 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  36.98 
 
 
443 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  36.72 
 
 
428 aa  255  8e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.24 
 
 
467 aa  252  8.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.77 
 
 
428 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  40.11 
 
 
439 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  35.34 
 
 
454 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  32.79 
 
 
462 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.7 
 
 
464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.7 
 
 
464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  34.25 
 
 
439 aa  242  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  38.9 
 
 
445 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  33.92 
 
 
410 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  36.06 
 
 
452 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  33.88 
 
 
462 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  33.25 
 
 
451 aa  222  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  33.81 
 
 
501 aa  222  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  33.5 
 
 
429 aa  222  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  34.76 
 
 
454 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  33.68 
 
 
429 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  33.68 
 
 
424 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  31.27 
 
 
446 aa  215  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  32.16 
 
 
424 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  33.16 
 
 
429 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33 
 
 
447 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  31.76 
 
 
431 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  32.35 
 
 
446 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  31.92 
 
 
431 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  34.67 
 
 
454 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  34.02 
 
 
503 aa  199  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  30.33 
 
 
428 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.57 
 
 
467 aa  186  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  31.5 
 
 
417 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  34.04 
 
 
459 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  32.39 
 
 
452 aa  176  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.42 
 
 
458 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  33.77 
 
 
459 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.98 
 
 
458 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  28.53 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.68 
 
 
425 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  27.08 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  28.5 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  27.21 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  28.17 
 
 
410 aa  119  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  26.19 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.59 
 
 
425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  22.47 
 
 
406 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  28.71 
 
 
633 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  27.21 
 
 
1200 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  28.36 
 
 
638 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  28.03 
 
 
409 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  25 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  27.53 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  25.83 
 
 
651 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  24.32 
 
 
648 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.25 
 
 
510 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  27.81 
 
 
1025 aa  73.2  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  27.09 
 
 
641 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  24.71 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.19 
 
 
677 aa  70.1  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  26.48 
 
 
820 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  29.58 
 
 
768 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.06 
 
 
735 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  25.08 
 
 
647 aa  67  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  27.78 
 
 
672 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.44 
 
 
685 aa  63.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.83 
 
 
458 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  22.93 
 
 
570 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  32.59 
 
 
308 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  24.42 
 
 
638 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  24.32 
 
 
500 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  25.1 
 
 
595 aa  59.7  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  31.21 
 
 
899 aa  59.7  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  25.77 
 
 
892 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  25.56 
 
 
711 aa  59.7  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  30.32 
 
 
707 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  27.03 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
1121 aa  56.2  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  29.86 
 
 
382 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0578  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.31 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.56022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>