137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0994 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  100 
 
 
416 aa  838    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  99.5 
 
 
400 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  94.25 
 
 
400 aa  760    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  99.52 
 
 
416 aa  835    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  99.52 
 
 
416 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  63.83 
 
 
432 aa  555  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  64.34 
 
 
422 aa  543  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  62.84 
 
 
423 aa  525  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  62.84 
 
 
423 aa  525  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  59.14 
 
 
431 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  59.14 
 
 
431 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  60.71 
 
 
428 aa  498  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  57.76 
 
 
423 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  58.77 
 
 
425 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  60.46 
 
 
400 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  37.65 
 
 
441 aa  288  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  39.32 
 
 
442 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  40.36 
 
 
437 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  36.9 
 
 
483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  37.66 
 
 
457 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.46 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  37.87 
 
 
428 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  36.72 
 
 
443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.87 
 
 
428 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  40.69 
 
 
439 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  37.37 
 
 
439 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  32.53 
 
 
462 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  34.95 
 
 
439 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  35.08 
 
 
454 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.22 
 
 
464 aa  240  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.22 
 
 
464 aa  240  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  33.98 
 
 
429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  34.41 
 
 
410 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  34.92 
 
 
501 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  35.71 
 
 
452 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  33.74 
 
 
451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  38.38 
 
 
445 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  34.7 
 
 
462 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  34.09 
 
 
446 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  32.24 
 
 
446 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  35.19 
 
 
454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  32.01 
 
 
424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  33.16 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  32.04 
 
 
424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.25 
 
 
447 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  35.77 
 
 
454 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  32.64 
 
 
429 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  31.51 
 
 
431 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  31.17 
 
 
431 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  33.76 
 
 
503 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  30 
 
 
428 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.77 
 
 
467 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  31.93 
 
 
452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  31.33 
 
 
417 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.78 
 
 
459 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.42 
 
 
458 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.98 
 
 
458 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  33.51 
 
 
459 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.94 
 
 
425 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  29.31 
 
 
422 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  25.91 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  29.21 
 
 
452 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  26.49 
 
 
418 aa  126  7e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  26.72 
 
 
405 aa  124  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  27.43 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.87 
 
 
425 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  23.38 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  28.86 
 
 
633 aa  103  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  26.1 
 
 
1200 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  28.43 
 
 
638 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.51 
 
 
510 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  26.07 
 
 
651 aa  83.2  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  27.67 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  24.62 
 
 
648 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  26.76 
 
 
641 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  26.01 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.95 
 
 
735 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  25.2 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  26.94 
 
 
820 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  31.93 
 
 
768 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  27.94 
 
 
595 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  24.53 
 
 
471 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  23.77 
 
 
1025 aa  68.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.27 
 
 
677 aa  67  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  30.05 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  24.84 
 
 
647 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  28 
 
 
672 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  26.51 
 
 
360 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  22.67 
 
 
570 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  31.21 
 
 
899 aa  61.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  25.14 
 
 
892 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.91 
 
 
685 aa  60.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  25.19 
 
 
711 aa  60.1  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  29.96 
 
 
707 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.81 
 
 
458 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  22.33 
 
 
505 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  23.47 
 
 
422 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  23.29 
 
 
500 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  21.81 
 
 
805 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  37.5 
 
 
550 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>