116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0677 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  84.03 
 
 
805 aa  1194    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  53.04 
 
 
831 aa  757    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  87.19 
 
 
892 aa  1217    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  100 
 
 
820 aa  1599    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 
1121 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  33 
 
 
564 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  27.22 
 
 
1001 aa  104  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  31.27 
 
 
940 aa  100  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  30.33 
 
 
641 aa  95.1  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  25.06 
 
 
595 aa  94  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  27.93 
 
 
1931 aa  90.1  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  26.55 
 
 
1332 aa  85.1  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  31.75 
 
 
810 aa  84.3  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  27.97 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  28.89 
 
 
871 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.87 
 
 
510 aa  80.9  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  26.44 
 
 
5743 aa  80.9  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  57.58 
 
 
913 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  32.71 
 
 
1092 aa  79.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  30.73 
 
 
635 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  51.4 
 
 
971 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  50.48 
 
 
969 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  50.48 
 
 
969 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  32.58 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  31.12 
 
 
777 aa  73.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  25.43 
 
 
1056 aa  72.4  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.94 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.94 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  26.98 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  26.98 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  29.48 
 
 
735 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  26.37 
 
 
675 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  26.48 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  27.74 
 
 
2552 aa  68.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  35.38 
 
 
461 aa  68.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  39.09 
 
 
547 aa  67  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  31.38 
 
 
1035 aa  67.4  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  31.68 
 
 
620 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  32.16 
 
 
245 aa  65.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  37.22 
 
 
352 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  41.49 
 
 
294 aa  62.4  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  34.16 
 
 
365 aa  60.8  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  29.56 
 
 
1224 aa  60.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.18 
 
 
425 aa  60.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  29.06 
 
 
14944 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  27.66 
 
 
638 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  25.19 
 
 
499 aa  58.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  30.97 
 
 
744 aa  58.2  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  26.85 
 
 
810 aa  58.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  30.74 
 
 
570 aa  57.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  29.95 
 
 
1025 aa  58.2  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  31.68 
 
 
1070 aa  57.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  31.68 
 
 
1070 aa  57.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  31.31 
 
 
1112 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  28.85 
 
 
1200 aa  57.4  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  29.14 
 
 
709 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  28.15 
 
 
1406 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  19.41 
 
 
1152 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2612  hypothetical protein  42.03 
 
 
295 aa  56.2  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  23.71 
 
 
954 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  29.9 
 
 
409 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.88 
 
 
626 aa  55.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.25 
 
 
1919 aa  54.7  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  28.9 
 
 
513 aa  54.3  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  24.45 
 
 
1219 aa  54.3  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.69 
 
 
626 aa  53.5  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  22.73 
 
 
724 aa  53.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.53 
 
 
458 aa  53.5  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  27.24 
 
 
1242 aa  53.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  28.3 
 
 
3586 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.71 
 
 
230 aa  53.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  25.62 
 
 
1096 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  26.74 
 
 
433 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  32.31 
 
 
1628 aa  52.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  25.77 
 
 
919 aa  52  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10920  Mannuronan C-5-Epimerase  34.85 
 
 
526 aa  52  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  29.21 
 
 
647 aa  51.2  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28.28 
 
 
12684 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  32.72 
 
 
707 aa  51.6  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  30.33 
 
 
505 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  34.09 
 
 
827 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.43 
 
 
2468 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  28.57 
 
 
467 aa  50.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1238  alginate biosynthesis protein AlgG  32.84 
 
 
536 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  29.91 
 
 
382 aa  50.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1058  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.09 
 
 
536 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0674089  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  24.26 
 
 
482 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0856  hypothetical protein  42.86 
 
 
89 aa  49.3  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.639444  normal  0.312248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  23.63 
 
 
2350 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  29.55 
 
 
1047 aa  47.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  23.03 
 
 
962 aa  48.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  27.78 
 
 
503 aa  47.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  41.82 
 
 
297 aa  47.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  25 
 
 
1951 aa  47.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  25.13 
 
 
341 aa  47.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0858  hypothetical protein  25.47 
 
 
229 aa  47  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.04 
 
 
587 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.67 
 
 
677 aa  47.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  24.43 
 
 
1141 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  26.92 
 
 
2042 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>