124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1206 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  100 
 
 		 677 aa  1338    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  28.61 
 
 		 1200 aa  124  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  30.21 
 
 		 570 aa  107  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.56 
 
 		 685 aa  98.2  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  31.42 
 
 		 647 aa  94.7  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  30 
 
 		 409 aa  88.6  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  36.73 
 
 		 707 aa  87.8  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  25.23 
 
 		 638 aa  87.4  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  27.56 
 
 		 648 aa  87  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  27.05 
 
 		 501 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.92 
 
 		 594 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  30.65 
 
 		 382 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  34.46 
 
 		 172 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  32 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  25.53 
 
 		 641 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  26.04 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.04 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  28.69 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  29.07 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  28.75 
 
 		 352 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  30.69 
 
 		 899 aa  73.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  24.49 
 
 		 871 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  24 
 
 		 1025 aa  72.4  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  29.73 
 
 		 308 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  26.76 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  28.19 
 
 		 400 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.1 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  29.58 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  29.58 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  24.93 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  29.23 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  29.23 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  29.03 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  26.25 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  33.81 
 
 		 1969 aa  65.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  26.49 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  28.77 
 
 		 595 aa  64.7  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  24.83 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  27.03 
 
 		 1242 aa  64.3  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  30.48 
 
 		 671 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  31.1 
 
 		 2036 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  29.94 
 
 		 2272 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  24.12 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.51 
 
 		 464 aa  60.1  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  25.43 
 
 		 500 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.51 
 
 		 464 aa  60.1  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  26.8 
 
 		 428 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  23.91 
 
 		 431 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  23.91 
 
 		 431 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  24.73 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  28.72 
 
 		 768 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  26.02 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.36 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  24.73 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  40.62 
 
 		 3295 aa  58.9  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  43.69 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  28 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  33.71 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  26.24 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.44 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  24.29 
 
 		 452 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  28.44 
 
 		 940 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  25.5 
 
 		 432 aa  55.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  24.25 
 
 		 443 aa  55.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  25.44 
 
 		 400 aa  55.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  25.88 
 
 		 831 aa  55.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  25.44 
 
 		 863 aa  55.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  24.65 
 
 		 423 aa  55.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.48 
 
 		 425 aa  54.7  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  23.14 
 
 		 1931 aa  54.7  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.1 
 
 		 458 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  26.18 
 
 		 457 aa  54.3  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.71 
 
 		 735 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 		 674 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  23.34 
 
 		 428 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  22.65 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  34.96 
 
 		 505 aa  53.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  22.65 
 
 		 424 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  25.41 
 
 		 439 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.94 
 
 		 458 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  21.69 
 
 		 429 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  23.46 
 
 		 452 aa  52  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23 
 
 		 424 aa  51.2  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  27.75 
 
 		 405 aa  51.2  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  23.14 
 
 		 454 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  30.52 
 
 		 441 aa  51.2  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.11 
 
 		 425 aa  50.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  27.67 
 
 		 820 aa  50.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1121 aa  50.8  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  32.89 
 
 		 302 aa  50.8  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  30.7 
 
 		 978 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  40 
 
 		 1682 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  25.36 
 
 		 805 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  26.27 
 
 		 503 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  28.87 
 
 		 892 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  24.01 
 
 		 422 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  26.35 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  24.92 
 
 		 446 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.35 
 
 		 230 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  20.98 
 
 		 459 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>