34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1661 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0487  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.81 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1421  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.05 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.670143  normal  0.74275 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0596  hypothetical protein  45 
 
 		 304 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.743466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0240  hypothetical protein  43.48 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  31.66 
 
 		 831 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  33.71 
 
 		 820 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0597  hypothetical protein  39 
 
 		 161 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3733  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.29 
 
 		 379 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00966756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  26.42 
 
 		 595 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  27.69 
 
 		 720 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  29.08 
 
 		 471 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.35 
 
 		 677 aa  49.7  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  28.49 
 
 		 871 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  26.88 
 
 		 1931 aa  48.5  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  35.61 
 
 		 892 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  31.65 
 
 		 352 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.01 
 
 		 425 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  28.11 
 
 		 1025 aa  45.1  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  28.33 
 
 		 461 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.86 
 
 		 458 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  29.41 
 
 		 483 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  33.71 
 
 		 805 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  28.05 
 
 		 641 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  25.34 
 
 		 417 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3133  hypothetical protein  28.1 
 
 		 623 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.717287  normal  0.669821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  26.32 
 
 		 635 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  28.08 
 
 		 810 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  26.51 
 
 		 1056 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  33.33 
 
 		 570 aa  43.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  30.4 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0803  hypothetical protein  32.76 
 
 		 427 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  22.58 
 
 		 428 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  30.72 
 
 		 365 aa  42.4  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>