56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1022 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  741    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.6 
 
 		 677 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  30.19 
 
 		 831 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  25.96 
 
 		 1931 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  28.4 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  33.68 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  27.34 
 
 		 647 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.92 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  30.34 
 
 		 1242 aa  60.1  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  36.88 
 
 		 899 aa  59.7  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  31 
 
 		 570 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  24.83 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  29.39 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.35 
 
 		 685 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  28.84 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  28.51 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  28.51 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  26.52 
 
 		 892 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  27.44 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.36 
 
 		 458 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  27.19 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  29.78 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  29.78 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  29.86 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  29.86 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  29.86 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  25.4 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 674 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  27.8 
 
 		 720 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  29.91 
 
 		 820 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  26.89 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  25.41 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  24.1 
 
 		 501 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  31.38 
 
 		 805 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  24.04 
 
 		 1332 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  25.19 
 
 		 595 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  25.77 
 
 		 1200 aa  47.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  30.07 
 
 		 1610 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  26.07 
 
 		 341 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  26.94 
 
 		 777 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  29.31 
 
 		 641 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  25.11 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0097  hypothetical protein  31.37 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0083  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  31.06 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0198036  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  25.11 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  30.07 
 
 		 1610 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  32.17 
 
 		 707 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  32.87 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  31.07 
 
 		 446 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  22.64 
 
 		 424 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1121 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  27.16 
 
 		 940 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  26.4 
 
 		 505 aa  43.5  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  29.11 
 
 		 960 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  27.54 
 
 		 1025 aa  43.1  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  31.01 
 
 		 1628 aa  42.7  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>