246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0779 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  100 
 
 
1332 aa  2707    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  41.05 
 
 
1242 aa  308  4.0000000000000004e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  37.38 
 
 
1628 aa  306  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  34.96 
 
 
712 aa  194  8e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  31.72 
 
 
718 aa  192  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  35.69 
 
 
1224 aa  159  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  30.94 
 
 
744 aa  120  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  35.84 
 
 
365 aa  120  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  27.98 
 
 
1096 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.17 
 
 
3586 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  33.57 
 
 
1047 aa  108  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  26 
 
 
2552 aa  108  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  30.32 
 
 
972 aa  107  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  27.43 
 
 
1219 aa  105  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  24.41 
 
 
5743 aa  98.2  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  26.35 
 
 
1695 aa  97.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  24.01 
 
 
1061 aa  96.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  27.48 
 
 
675 aa  95.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  23.87 
 
 
1428 aa  93.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  30.07 
 
 
482 aa  89  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  23.76 
 
 
1951 aa  88.6  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  31.16 
 
 
499 aa  85.1  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  26.4 
 
 
820 aa  84.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  26.79 
 
 
4689 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  29.46 
 
 
789 aa  83.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  25.29 
 
 
831 aa  82.8  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  27.86 
 
 
2117 aa  82.4  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  27.57 
 
 
535 aa  82  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.56 
 
 
6885 aa  79.7  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.26 
 
 
587 aa  78.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  27.53 
 
 
820 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  25.5 
 
 
1424 aa  78.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  25.55 
 
 
487 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  25.99 
 
 
892 aa  77.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.37 
 
 
1919 aa  78.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.83 
 
 
5216 aa  77  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  22.86 
 
 
647 aa  77  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  24.51 
 
 
3325 aa  76.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  29.06 
 
 
2042 aa  76.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  33.18 
 
 
1222 aa  75.5  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  25.39 
 
 
5561 aa  73.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  25.3 
 
 
870 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  29.79 
 
 
1141 aa  74.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  29.73 
 
 
373 aa  73.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  25.91 
 
 
1278 aa  73.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  22.46 
 
 
898 aa  72.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  22.2 
 
 
1554 aa  72.8  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  24.48 
 
 
1457 aa  72.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  25.4 
 
 
1657 aa  72.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  23.08 
 
 
1902 aa  72  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  23.53 
 
 
5561 aa  71.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  23.11 
 
 
2350 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  28.12 
 
 
711 aa  71.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  26.72 
 
 
1804 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  23.31 
 
 
5559 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.41 
 
 
587 aa  69.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  24.16 
 
 
1152 aa  69.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  23.31 
 
 
5561 aa  69.3  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  23.31 
 
 
5559 aa  69.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  27.16 
 
 
3562 aa  69.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  21.74 
 
 
2528 aa  68.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  24.4 
 
 
3824 aa  68.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  24.08 
 
 
777 aa  68.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0688  Fibronectin type III domain protein  29.84 
 
 
513 aa  68.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  21.56 
 
 
899 aa  68.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.93 
 
 
685 aa  68.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  27.35 
 
 
494 aa  68.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  25.06 
 
 
1825 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  24.17 
 
 
3739 aa  67.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  24.83 
 
 
805 aa  67  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  24.78 
 
 
4106 aa  67  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  25.79 
 
 
437 aa  65.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  24.45 
 
 
3721 aa  65.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  22.89 
 
 
442 aa  65.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  25.97 
 
 
1092 aa  64.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  27.31 
 
 
410 aa  64.3  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  44.32 
 
 
1025 aa  63.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  25.17 
 
 
4430 aa  64.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.87 
 
 
510 aa  63.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.1 
 
 
3552 aa  63.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  26.28 
 
 
895 aa  63.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  22.64 
 
 
913 aa  62.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  26.1 
 
 
641 aa  62.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  28.47 
 
 
513 aa  63.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  32.62 
 
 
341 aa  62.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  25.7 
 
 
725 aa  62.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  28.44 
 
 
455 aa  61.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  28.44 
 
 
455 aa  61.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  28.39 
 
 
3227 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  26.4 
 
 
3516 aa  61.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.02 
 
 
3824 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  28.62 
 
 
827 aa  61.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  25.08 
 
 
888 aa  60.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  29.17 
 
 
455 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.72 
 
 
692 aa  60.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  25.88 
 
 
2402 aa  60.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.52 
 
 
1143 aa  59.7  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  26.67 
 
 
2353 aa  60.1  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  30.45 
 
 
505 aa  60.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  22.25 
 
 
3925 aa  59.7  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>