53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1726 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  100 
 
 		 789 aa  1629    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  39.65 
 
 		 820 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  33.01 
 
 		 599 aa  204  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  33.76 
 
 		 535 aa  137  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  27.17 
 
 		 1242 aa  94.7  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  28.46 
 
 		 487 aa  92  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  26.84 
 
 		 1628 aa  90.5  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  29.48 
 
 		 712 aa  89  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  29.58 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  29.58 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  29.46 
 
 		 1332 aa  83.2  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  25.08 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  29.36 
 
 		 718 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  26.67 
 
 		 307 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  24.65 
 
 		 255 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  26.92 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  24.53 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  26.24 
 
 		 270 aa  67  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  25 
 
 		 494 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  52.94 
 
 		 814 aa  65.1  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  24.78 
 
 		 616 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  25.81 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  28.02 
 
 		 1066 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  23.46 
 
 		 407 aa  60.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  35.29 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  27.48 
 
 		 812 aa  57.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  27.23 
 
 		 1202 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  24.82 
 
 		 307 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  27.63 
 
 		 934 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  26.81 
 
 		 268 aa  55.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  26.83 
 
 		 307 aa  55.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  27.19 
 
 		 619 aa  55.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  26.12 
 
 		 323 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  26.58 
 
 		 284 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.55 
 
 		 395 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  23.18 
 
 		 303 aa  52  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.28 
 
 		 395 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.74 
 
 		 395 aa  52  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  21.19 
 
 		 901 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3154  hypothetical protein  29.93 
 
 		 631 aa  51.2  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.164464  hitchhiker  0.00920589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 395 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 395 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 395 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 395 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  22.22 
 
 		 396 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.19 
 
 		 395 aa  48.9  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.19 
 
 		 395 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  25.89 
 
 		 368 aa  48.9  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  23.14 
 
 		 224 aa  48.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.561338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.36 
 
 		 395 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  24.9 
 
 		 395 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  26.91 
 
 		 496 aa  45.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1427  Pyrrolo-quinoline quinone  24.64 
 
 		 385 aa  44.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>