51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21200 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  100 
 
 		 513 aa  1035    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  32.14 
 
 		 653 aa  109  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.91 
 
 		 1505 aa  80.5  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  29.48 
 
 		 1795 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1664  hypothetical protein  28.42 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000631476  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  33.16 
 
 		 5743 aa  70.5  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  29.72 
 
 		 1428 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  28.31 
 
 		 831 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  28.47 
 
 		 1332 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  28.95 
 
 		 1194 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  28.57 
 
 		 892 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  26.87 
 
 		 1224 aa  61.6  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  27.15 
 
 		 805 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  29.68 
 
 		 1570 aa  60.5  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  26.46 
 
 		 793 aa  60.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  29.08 
 
 		 820 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  32.37 
 
 		 1424 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  27.96 
 
 		 1570 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  35.63 
 
 		 1121 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  25.93 
 
 		 1152 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  27.8 
 
 		 3227 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  27.17 
 
 		 881 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  26.13 
 
 		 1951 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1457 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3188  protease-associated PA  41.94 
 
 		 567 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  27.21 
 
 		 5561 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  31.82 
 
 		 3734 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3304  protease-associated PA domain protein  41.94 
 
 		 567 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  26.74 
 
 		 675 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  29.34 
 
 		 1146 aa  47.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  30.57 
 
 		 913 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  29.28 
 
 		 1054 aa  47.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1657 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  29.36 
 
 		 2522 aa  47.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  27.22 
 
 		 5561 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1792 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  35.05 
 
 		 655 aa  47  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  30.15 
 
 		 1047 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  30.88 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  29.23 
 
 		 5451 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.15 
 
 		 503 aa  45.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.76 
 
 		 5216 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  27.96 
 
 		 312 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.76 
 
 		 3552 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  30.07 
 
 		 2402 aa  43.9  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  35.29 
 
 		 373 aa  44.3  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.25 
 
 		 587 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  26.72 
 
 		 5559 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  26.72 
 
 		 5559 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  27.24 
 
 		 3544 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  28.06 
 
 		 3736 aa  43.5  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>