88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3016 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  100 
 
 		 1825 aa  3594    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1657 aa  226  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  31.95 
 
 		 513 aa  154  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0119  M6 family metalloprotease domain protein  27.87 
 
 		 1114 aa  137  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.211845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  28.94 
 
 		 1096 aa  117  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  28.81 
 
 		 735 aa  116  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  28.94 
 
 		 1028 aa  115  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  32.72 
 
 		 1902 aa  110  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  39.66 
 
 		 793 aa  107  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0709  hypothetical protein  27.51 
 
 		 733 aa  105  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247349  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  27.34 
 
 		 1951 aa  104  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  31.37 
 
 		 566 aa  103  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  60.24 
 
 		 715 aa  100  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0603  M6 family metalloprotease domain protein  28.44 
 
 		 1024 aa  96.7  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.460158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  63.29 
 
 		 604 aa  95.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  40.77 
 
 		 2117 aa  89.4  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.33 
 
 		 3227 aa  86.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2456  secreted metalloprotease  22.91 
 
 		 543 aa  85.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.055863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  44.34 
 
 		 637 aa  84.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  35.47 
 
 		 599 aa  84  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  26.89 
 
 		 1004 aa  82.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.17 
 
 		 1919 aa  82  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1076 aa  79.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  32.76 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  29.91 
 
 		 635 aa  76.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  25.14 
 
 		 998 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1026 aa  73.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  46.43 
 
 		 878 aa  73.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2775  hypothetical protein  45.1 
 
 		 1201 aa  73.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  25.97 
 
 		 1428 aa  73.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.03 
 
 		 692 aa  73.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  45.24 
 
 		 878 aa  72.4  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  26.42 
 
 		 1332 aa  71.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  33.08 
 
 		 514 aa  71.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  23.47 
 
 		 480 aa  69.7  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  41.96 
 
 		 312 aa  68.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  28.12 
 
 		 5743 aa  67.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  27.11 
 
 		 1424 aa  67  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2865  Fibronectin type III domain protein  36.3 
 
 		 759 aa  64.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  21.45 
 
 		 2552 aa  64.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  23.43 
 
 		 994 aa  63.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  27 
 
 		 1795 aa  63.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.58 
 
 		 322 aa  60.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40744  predicted protein  26.73 
 
 		 583 aa  60.1  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1061 aa  60.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  25.33 
 
 		 653 aa  57.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  34.05 
 
 		 652 aa  57.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  23.41 
 
 		 778 aa  56.2  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  39.29 
 
 		 878 aa  55.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  38.46 
 
 		 264 aa  55.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.21 
 
 		 940 aa  54.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.65 
 
 		 639 aa  53.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  32.2 
 
 		 758 aa  53.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  26.49 
 
 		 3734 aa  52.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  25.52 
 
 		 1762 aa  52  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.37 
 
 		 811 aa  52  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  34.25 
 
 		 1226 aa  52  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  40.82 
 
 		 551 aa  52  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  36.84 
 
 		 1937 aa  51.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.11 
 
 		 788 aa  50.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  40.79 
 
 		 788 aa  49.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  35.77 
 
 		 1128 aa  49.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0343  hypothetical protein  38.66 
 
 		 913 aa  49.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  40.79 
 
 		 788 aa  49.3  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0647  hypothetical protein  25.99 
 
 		 915 aa  49.3  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.449731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.79 
 
 		 788 aa  48.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  39.47 
 
 		 788 aa  49.3  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  39.74 
 
 		 864 aa  48.9  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  46.97 
 
 		 848 aa  48.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  38.67 
 
 		 1467 aa  48.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  47.37 
 
 		 788 aa  48.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  26.62 
 
 		 918 aa  48.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  24.5 
 
 		 5298 aa  48.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  47.37 
 
 		 788 aa  48.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.89 
 
 		 788 aa  47.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  31.53 
 
 		 815 aa  47.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  34.75 
 
 		 711 aa  47.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  26.06 
 
 		 3736 aa  47.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  31.25 
 
 		 3586 aa  46.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  39.47 
 
 		 788 aa  46.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  26.87 
 
 		 6497 aa  46.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6764  M6 family metalloprotease domain protein  28.32 
 
 		 416 aa  46.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  30.71 
 
 		 812 aa  45.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  31.43 
 
 		 794 aa  45.8  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  39.33 
 
 		 1756 aa  45.8  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3358  hypothetical protein  28.06 
 
 		 743 aa  45.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0199152 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  50 
 
 		 690 aa  45.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  27.57 
 
 		 869 aa  45.4  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>