201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3153 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 
322 aa  653    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  61.45 
 
 
264 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.97 
 
 
602 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  36.62 
 
 
589 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  44 
 
 
541 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  42.06 
 
 
167 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  43.09 
 
 
209 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  41.8 
 
 
245 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  44.35 
 
 
338 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  37.31 
 
 
270 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  42.4 
 
 
270 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  42.4 
 
 
276 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.46 
 
 
213 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  42.4 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  42.4 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  42.4 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  42.4 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  42.4 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  42.4 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  42.4 
 
 
263 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  42.4 
 
 
270 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  39.44 
 
 
347 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  40.8 
 
 
283 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  42.15 
 
 
249 aa  93.2  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  44.26 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  40.16 
 
 
242 aa  90.9  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  39.34 
 
 
500 aa  90.9  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  39.01 
 
 
254 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  39.2 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  38.21 
 
 
465 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.73 
 
 
300 aa  90.1  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  42.62 
 
 
203 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  41.13 
 
 
495 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  38.52 
 
 
458 aa  86.3  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  38.4 
 
 
244 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.4 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.09 
 
 
178 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  37.41 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  43.09 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.09 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  38.52 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  36.51 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.4 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.5 
 
 
444 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  36.25 
 
 
196 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  38.21 
 
 
211 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  35.21 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  36.29 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  38.52 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  39.52 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  38.21 
 
 
285 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  35.92 
 
 
226 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  34.96 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  37.9 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  35.56 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  37.38 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  36.8 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  32.48 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  31.78 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  35.77 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  37.23 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  30.25 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  32.8 
 
 
168 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  35.77 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  26.02 
 
 
551 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  36.07 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  29.71 
 
 
170 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  29.58 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  40 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  37.5 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  34.76 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  28.87 
 
 
344 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  28.87 
 
 
344 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  35.25 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  37.8 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  35.48 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  28.87 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  28.87 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  28.87 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  28.87 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  32.85 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  28.87 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1260  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.65 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  33.79 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  32.26 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  30 
 
 
200 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  29.55 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  30.43 
 
 
170 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  29.93 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.8 
 
 
129 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  32.65 
 
 
179 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  28.17 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  33.96 
 
 
200 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  34.11 
 
 
335 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  34.4 
 
 
290 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  28.57 
 
 
353 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  32.11 
 
 
169 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  29.46 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.94 
 
 
140 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>