129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0979 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  100 
 
 		 6497 aa  12840    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  26.47 
 
 		 5298 aa  565  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  29.49 
 
 		 2402 aa  479  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  30.92 
 
 		 2262 aa  280  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  25.22 
 
 		 4044 aa  276  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  25.72 
 
 		 3958 aa  268  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1804 aa  249  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  28.07 
 
 		 3793 aa  226  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  26.72 
 
 		 874 aa  171  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  27.87 
 
 		 2713 aa  164  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  25.38 
 
 		 1463 aa  143  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  28.82 
 
 		 759 aa  125  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1064 aa  123  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  28.63 
 
 		 561 aa  122  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  25.33 
 
 		 2270 aa  120  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  35.11 
 
 		 774 aa  120  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  27.03 
 
 		 890 aa  107  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  25.72 
 
 		 5544 aa  106  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  39.42 
 
 		 1097 aa  106  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  35.82 
 
 		 726 aa  95.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  32.2 
 
 		 3227 aa  92  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1547 aa  91.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.54 
 
 		 1657 aa  87  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  34.19 
 
 		 2364 aa  86.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  34.19 
 
 		 860 aa  85.1  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  25.19 
 
 		 885 aa  84.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  30.39 
 
 		 540 aa  84.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  26.66 
 
 		 3794 aa  82.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  28 
 
 		 766 aa  82.4  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  37.72 
 
 		 627 aa  83.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  35 
 
 		 873 aa  82.4  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  27.78 
 
 		 534 aa  81.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  25.37 
 
 		 532 aa  81.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1634 aa  80.9  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  27.22 
 
 		 2833 aa  80.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  31.78 
 
 		 1266 aa  79.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.98 
 
 		 991 aa  78.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  33.1 
 
 		 2421 aa  77.4  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  38.39 
 
 		 1371 aa  77.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  33.1 
 
 		 2367 aa  77  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  33.1 
 
 		 2411 aa  77  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.94 
 
 		 2927 aa  77  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  26.9 
 
 		 535 aa  77  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  33.1 
 
 		 2454 aa  75.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  33.1 
 
 		 2807 aa  73.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  32.56 
 
 		 815 aa  73.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  40.23 
 
 		 2005 aa  70.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  30.96 
 
 		 1162 aa  70.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  33.12 
 
 		 2296 aa  68.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1193 aa  68.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  37.76 
 
 		 1389 aa  68.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1163 aa  68.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  24.25 
 
 		 503 aa  68.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  33.63 
 
 		 1059 aa  67.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  33.96 
 
 		 1526 aa  67.4  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  33.68 
 
 		 822 aa  67.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  35.48 
 
 		 4896 aa  66.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.07 
 
 		 4071 aa  65.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  35.92 
 
 		 808 aa  66.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  33.07 
 
 		 1140 aa  65.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  26.15 
 
 		 1222 aa  64.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  30.36 
 
 		 3737 aa  63.9  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  29.71 
 
 		 1748 aa  63.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1329 aa  63.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  32.43 
 
 		 886 aa  62.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  34.48 
 
 		 5745 aa  62  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1488 aa  61.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  34.62 
 
 		 792 aa  61.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  25.25 
 
 		 967 aa  60.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  28.14 
 
 		 750 aa  60.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  33.67 
 
 		 799 aa  60.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1259 aa  59.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  29.54 
 
 		 1002 aa  59.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  35.56 
 
 		 711 aa  59.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  41.89 
 
 		 3602 aa  60.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  31.3 
 
 		 3471 aa  59.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  33.11 
 
 		 1483 aa  59.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1676  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1460 aa  59.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  33.33 
 
 		 2772 aa  58.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  41.79 
 
 		 1139 aa  58.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  34.67 
 
 		 1066 aa  57.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1313 aa  57.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  29.51 
 
 		 1620 aa  57.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1147 aa  56.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  31.42 
 
 		 1288 aa  55.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  34.48 
 
 		 429 aa  56.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  30.77 
 
 		 1474 aa  55.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  28.48 
 
 		 677 aa  55.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  33.87 
 
 		 1606 aa  55.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  41.67 
 
 		 969 aa  55.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  38.46 
 
 		 2980 aa  55.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1287 aa  55.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  31.53 
 
 		 496 aa  54.7  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  33.04 
 
 		 968 aa  54.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  41.67 
 
 		 963 aa  54.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  35.11 
 
 		 950 aa  54.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  31.87 
 
 		 3324 aa  53.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1245 aa  53.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  30.37 
 
 		 1585 aa  52.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.34 
 
 		 1679 aa  53.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>