96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3916 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  100 
 
 		 967 aa  1982    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  27.62 
 
 		 532 aa  109  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  25.17 
 
 		 540 aa  101  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  28.52 
 
 		 535 aa  101  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  31.54 
 
 		 503 aa  94.7  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  27.55 
 
 		 534 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  26.74 
 
 		 885 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  23.55 
 
 		 2402 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1064 aa  79  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  23.73 
 
 		 890 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  34.75 
 
 		 650 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  23.47 
 
 		 1222 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1287 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  31.25 
 
 		 886 aa  71.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  27.93 
 
 		 774 aa  70.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1804 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1139 aa  68.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  34.74 
 
 		 652 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  31.9 
 
 		 541 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  37.89 
 
 		 598 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  28.99 
 
 		 2833 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  30.25 
 
 		 873 aa  65.5  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  26.14 
 
 		 1097 aa  65.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  27.41 
 
 		 808 aa  64.7  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  31.36 
 
 		 642 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  34.17 
 
 		 4071 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  40.23 
 
 		 677 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  39.78 
 
 		 1140 aa  63.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  40.86 
 
 		 1488 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  24.76 
 
 		 4429 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  30.77 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  34.26 
 
 		 1371 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  37.21 
 
 		 1230 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1245 aa  61.6  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  25.25 
 
 		 6497 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  29.03 
 
 		 429 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  33.7 
 
 		 3737 aa  60.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  30.25 
 
 		 627 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  27.87 
 
 		 496 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  21.56 
 
 		 874 aa  60.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1163 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  32.56 
 
 		 3542 aa  58.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  28.32 
 
 		 2980 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  31.25 
 
 		 1389 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  29.84 
 
 		 766 aa  57.4  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  27.97 
 
 		 662 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1547 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  30.97 
 
 		 1602 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  30.51 
 
 		 1620 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  26.72 
 
 		 938 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  21.95 
 
 		 1463 aa  55.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  30 
 
 		 694 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  26.85 
 
 		 2364 aa  55.1  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  26.85 
 
 		 860 aa  54.7  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  31.46 
 
 		 1466 aa  54.7  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  32.97 
 
 		 2972 aa  54.7  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  29.31 
 
 		 3958 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  26.03 
 
 		 815 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  30.08 
 
 		 1606 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  35.29 
 
 		 1162 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  31.46 
 
 		 3851 aa  52  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  29.33 
 
 		 2377 aa  52  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1059 aa  51.6  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  34.02 
 
 		 2588 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  29.21 
 
 		 561 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  29.89 
 
 		 496 aa  50.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  23.66 
 
 		 726 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  29.2 
 
 		 5298 aa  50.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  30.23 
 
 		 658 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  32.94 
 
 		 3227 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  31.87 
 
 		 3682 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  32.69 
 
 		 676 aa  49.7  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  30 
 
 		 1313 aa  49.3  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  30.43 
 
 		 799 aa  49.3  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1066 aa  49.3  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  26.5 
 
 		 636 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  34.88 
 
 		 640 aa  48.5  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  28 
 
 		 689 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  26.12 
 
 		 4896 aa  48.5  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  26.85 
 
 		 2296 aa  48.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  38.75 
 
 		 1259 aa  48.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  26.49 
 
 		 3927 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  20.84 
 
 		 2262 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.12 
 
 		 2927 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  20.25 
 
 		 2713 aa  47  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  37.88 
 
 		 3602 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  20.97 
 
 		 759 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2005 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  30.39 
 
 		 822 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  31.76 
 
 		 1526 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  26.61 
 
 		 637 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  29.79 
 
 		 4044 aa  45.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1193 aa  45.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  36.36 
 
 		 2772 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  32.26 
 
 		 750 aa  45.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 794 aa  44.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>