163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2924 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  100 
 
 		 1064 aa  2177    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  32.73 
 
 		 561 aa  320  6e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  36.12 
 
 		 2402 aa  251  5e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  36.38 
 
 		 2262 aa  234  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  28.16 
 
 		 1463 aa  168  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1547 aa  149  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  29.1 
 
 		 885 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1804 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  29.55 
 
 		 2713 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  28.53 
 
 		 540 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  28.9 
 
 		 534 aa  131  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  27.29 
 
 		 890 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  26.27 
 
 		 5298 aa  127  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  27.41 
 
 		 532 aa  125  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  24.78 
 
 		 6497 aa  123  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  25.89 
 
 		 503 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  29.76 
 
 		 874 aa  122  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  31.03 
 
 		 535 aa  118  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  27.92 
 
 		 1222 aa  114  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1139 aa  111  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  27.79 
 
 		 759 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  26.76 
 
 		 815 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  27.88 
 
 		 1371 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  40.65 
 
 		 1389 aa  104  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  27.36 
 
 		 5544 aa  98.6  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  25.65 
 
 		 792 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  26.51 
 
 		 3794 aa  95.9  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  27.69 
 
 		 822 aa  94.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  29.06 
 
 		 652 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1193 aa  92  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  25.17 
 
 		 799 aa  90.9  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  37.5 
 
 		 3227 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  29.91 
 
 		 627 aa  90.5  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  27.11 
 
 		 2270 aa  90.1  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  30.14 
 
 		 774 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  24.59 
 
 		 1068 aa  85.1  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  35.07 
 
 		 1162 aa  84.7  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1313 aa  84  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  27.5 
 
 		 1483 aa  84  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1163 aa  82  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  23.65 
 
 		 4044 aa  81.6  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.43 
 
 		 1679 aa  80.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  42.17 
 
 		 3737 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  22.64 
 
 		 967 aa  79.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  34.65 
 
 		 750 aa  79  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  46.97 
 
 		 2927 aa  78.2  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  42.35 
 
 		 3602 aa  77.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  42.68 
 
 		 1066 aa  77.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  28.32 
 
 		 794 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  40.74 
 
 		 2005 aa  76.3  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  25.55 
 
 		 3958 aa  76.3  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  41.25 
 
 		 1526 aa  75.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  31.25 
 
 		 637 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  40 
 
 		 2296 aa  75.1  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1488 aa  74.7  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  44.83 
 
 		 852 aa  74.3  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  24.61 
 
 		 938 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  26.35 
 
 		 989 aa  73.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  25.94 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  39.02 
 
 		 3324 aa  71.2  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  40.7 
 
 		 711 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  30.21 
 
 		 642 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  34.55 
 
 		 2367 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  34.55 
 
 		 2421 aa  71.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  34.55 
 
 		 2454 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  33.64 
 
 		 2411 aa  71.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  28.43 
 
 		 2807 aa  70.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  24.67 
 
 		 4071 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  24.05 
 
 		 1466 aa  68.9  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  27.57 
 
 		 650 aa  68.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  25.05 
 
 		 3793 aa  68.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1059 aa  68.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  39.47 
 
 		 871 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1259 aa  67  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  32.17 
 
 		 1230 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1245 aa  65.1  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  25.98 
 
 		 2980 aa  65.1  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  34.78 
 
 		 4896 aa  65.1  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  26.67 
 
 		 1140 aa  64.3  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  31.63 
 
 		 2772 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1018  thermopsin  26.2 
 
 		 952 aa  64.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0978818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  26.2 
 
 		 1097 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  22.4 
 
 		 886 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  34 
 
 		 1606 aa  64.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  34.25 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  23.63 
 
 		 2833 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  37.23 
 
 		 5745 aa  61.6  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  36.9 
 
 		 3542 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.04 
 
 		 991 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  23.53 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  25.69 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  25.29 
 
 		 1266 aa  59.7  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  24.27 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1665 aa  59.3  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  39.71 
 
 		 694 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  25.82 
 
 		 808 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5679  PKD domain containing protein  23.49 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  22.9 
 
 		 662 aa  58.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  35.16 
 
 		 3191 aa  58.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  29.75 
 
 		 3851 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>