More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2196 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  59.03 
 
 		 1371 aa  1639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1389 aa  2854    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  50.22 
 
 		 2972 aa  663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  41.86 
 
 		 2980 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  25.15 
 
 		 1162 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  31.16 
 
 		 650 aa  189  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.06 
 
 		 1606 aa  164  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.38 
 
 		 2272 aa  164  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  31.63 
 
 		 627 aa  160  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  26.4 
 
 		 1466 aa  157  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  30.04 
 
 		 815 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  30.87 
 
 		 1667 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  28.9 
 
 		 1094 aa  152  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  27.79 
 
 		 1620 aa  149  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  29.85 
 
 		 799 aa  144  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1682 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  27.3 
 
 		 1862 aa  139  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1667 aa  135  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  28.66 
 
 		 963 aa  135  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  29.85 
 
 		 822 aa  132  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.37 
 
 		 752 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  24.97 
 
 		 1602 aa  126  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  33.68 
 
 		 859 aa  125  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  31.17 
 
 		 1361 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  29.53 
 
 		 561 aa  123  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  31.54 
 
 		 735 aa  121  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  27.17 
 
 		 978 aa  121  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  29.78 
 
 		 1236 aa  121  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  25.25 
 
 		 2807 aa  121  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  31.6 
 
 		 2554 aa  121  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  26.28 
 
 		 2176 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  25.25 
 
 		 2411 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  25.25 
 
 		 2367 aa  119  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  25.71 
 
 		 1814 aa  119  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  25.45 
 
 		 2454 aa  118  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  28.88 
 
 		 1230 aa  118  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  25.45 
 
 		 2421 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  27.46 
 
 		 1783 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  31.23 
 
 		 642 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  29.03 
 
 		 1842 aa  116  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  30.26 
 
 		 637 aa  116  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  34.87 
 
 		 792 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  28.95 
 
 		 958 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  33.5 
 
 		 2772 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  33.12 
 
 		 2036 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  31.27 
 
 		 1300 aa  112  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  35.28 
 
 		 460 aa  111  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  28.03 
 
 		 1387 aa  111  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  25.92 
 
 		 575 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  26.92 
 
 		 1011 aa  110  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 1732 aa  110  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  30.42 
 
 		 734 aa  110  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  32.87 
 
 		 1356 aa  110  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  31.11 
 
 		 528 aa  107  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  31.75 
 
 		 1882 aa  107  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  33.46 
 
 		 823 aa  107  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  35.37 
 
 		 2000 aa  106  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  29.36 
 
 		 1120 aa  105  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  28.74 
 
 		 2122 aa  106  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  40.65 
 
 		 1064 aa  104  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  30.34 
 
 		 1241 aa  104  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  30.34 
 
 		 1969 aa  104  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  32.42 
 
 		 675 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  30.65 
 
 		 861 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  33.7 
 
 		 3295 aa  103  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  26.7 
 
 		 1528 aa  101  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1059 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  34.32 
 
 		 750 aa  101  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  35.66 
 
 		 3227 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  30.12 
 
 		 551 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  26.09 
 
 		 794 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2757  hypothetical protein  26.28 
 
 		 623 aa  100  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0366387  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  34.84 
 
 		 821 aa  99.8  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  31.25 
 
 		 581 aa  99.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  24.62 
 
 		 1057 aa  99.4  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  33.59 
 
 		 870 aa  99  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  29.78 
 
 		 615 aa  99  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  32.97 
 
 		 929 aa  98.6  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  27.32 
 
 		 1987 aa  98.6  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  32.63 
 
 		 802 aa  98.6  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  33.22 
 
 		 658 aa  97.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  35.82 
 
 		 910 aa  97.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  29.47 
 
 		 679 aa  97.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  31.82 
 
 		 669 aa  97.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  25.94 
 
 		 941 aa  96.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  31.92 
 
 		 547 aa  95.9  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  33.77 
 
 		 1095 aa  95.5  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  28.49 
 
 		 845 aa  95.1  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  32.88 
 
 		 685 aa  94.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  31.74 
 
 		 719 aa  94.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.84 
 
 		 713 aa  94  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  27.54 
 
 		 636 aa  94  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  34.94 
 
 		 1282 aa  93.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  32.27 
 
 		 819 aa  93.6  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  31.38 
 
 		 791 aa  92.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  27.27 
 
 		 865 aa  92.4  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  31.98 
 
 		 1292 aa  92  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  32.58 
 
 		 443 aa  91.3  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  32.58 
 
 		 930 aa  91.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  29.43 
 
 		 869 aa  90.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>