111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4934 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  100 
 
 
774 aa  1573    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  35.66 
 
 
766 aa  421  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01070  hypothetical protein  36.31 
 
 
1030 aa  251  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  36.15 
 
 
1097 aa  204  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  33.43 
 
 
873 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  34.04 
 
 
726 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  27.91 
 
 
860 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  27.91 
 
 
2364 aa  125  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  35.11 
 
 
6497 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  42.86 
 
 
1634 aa  97.4  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4344  hypothetical protein  30.74 
 
 
321 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0548812  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  30.14 
 
 
1064 aa  87.4  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  38.39 
 
 
5298 aa  85.5  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  26.11 
 
 
532 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  26.56 
 
 
938 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0174  hypothetical protein  28.82 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.023441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  27.59 
 
 
3227 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  23.91 
 
 
503 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  26.67 
 
 
561 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  28.65 
 
 
4044 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  37.61 
 
 
3958 aa  75.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  26.73 
 
 
534 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  25.41 
 
 
535 aa  75.1  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  25.44 
 
 
540 aa  73.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  27.96 
 
 
1488 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  26.86 
 
 
886 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  23.56 
 
 
885 aa  71.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  30.58 
 
 
1371 aa  70.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  28.37 
 
 
815 aa  70.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  25.48 
 
 
627 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  27.93 
 
 
967 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  33.64 
 
 
1526 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  31.78 
 
 
2296 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  29.41 
 
 
890 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.94 
 
 
2927 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  27.27 
 
 
4071 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  26.46 
 
 
1547 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  28.27 
 
 
1313 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  30.46 
 
 
750 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  24.43 
 
 
1230 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  25.91 
 
 
871 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  23.63 
 
 
2980 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  26.56 
 
 
1259 aa  61.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  26.87 
 
 
1139 aa  60.8  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  25 
 
 
2833 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  27.45 
 
 
1066 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  26.89 
 
 
1287 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  24.1 
 
 
496 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  26.75 
 
 
1466 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  34.88 
 
 
3737 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  28.1 
 
 
1162 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  33.72 
 
 
4429 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  25.94 
 
 
1389 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03245  hypothetical protein  36.73 
 
 
406 aa  58.5  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  24.74 
 
 
1222 aa  57.4  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.61 
 
 
1679 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  29.1 
 
 
2064 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0857  hypothetical protein  28.64 
 
 
1280 aa  57  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  26.84 
 
 
794 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  31.69 
 
 
874 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  24.07 
 
 
3542 aa  55.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  37.21 
 
 
652 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  25.65 
 
 
792 aa  54.3  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  33.33 
 
 
1059 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  31.88 
 
 
429 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  21.47 
 
 
799 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  30.83 
 
 
1140 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  34.69 
 
 
2972 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  29.91 
 
 
2367 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  29.91 
 
 
2411 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  23.94 
 
 
2772 aa  51.6  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  26.21 
 
 
1193 aa  51.6  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  34.43 
 
 
2262 aa  51.2  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  25.71 
 
 
1657 aa  51.2  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  32.56 
 
 
598 aa  50.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  29.25 
 
 
2421 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  29.25 
 
 
2454 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  26.36 
 
 
3324 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  25.58 
 
 
490 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  30 
 
 
1170 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  27.75 
 
 
822 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  24.08 
 
 
530 aa  49.7  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  26.55 
 
 
1245 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  29.25 
 
 
2807 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  24.38 
 
 
636 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  23.43 
 
 
650 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  24.94 
 
 
991 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  22.84 
 
 
1620 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  34.69 
 
 
759 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  25.32 
 
 
1804 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  30 
 
 
1463 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  30.43 
 
 
658 aa  47.8  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  28.12 
 
 
2402 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  31.4 
 
 
640 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  25.99 
 
 
4896 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  27.78 
 
 
711 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  32 
 
 
694 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  23.01 
 
 
541 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  31.43 
 
 
1163 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  27.43 
 
 
808 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>