81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1336 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  30.68 
 
 		 3958 aa  1386    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  100 
 
 		 4044 aa  8272    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  24.7 
 
 		 5298 aa  303  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  25.28 
 
 		 6497 aa  273  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  24.41 
 
 		 2402 aa  124  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1064 aa  86.7  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  45.98 
 
 		 2364 aa  84.3  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  45.98 
 
 		 860 aa  83.6  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1634 aa  82.4  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  24.95 
 
 		 2262 aa  81.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  37.5 
 
 		 3227 aa  79.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  24.46 
 
 		 759 aa  79.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  24.36 
 
 		 561 aa  79  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  35.78 
 
 		 1097 aa  77.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  28.65 
 
 		 774 aa  75.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  26.89 
 
 		 726 aa  74.3  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  29.55 
 
 		 873 aa  74.3  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  39.77 
 
 		 766 aa  74.3  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  22.46 
 
 		 1463 aa  71.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  23.99 
 
 		 815 aa  69.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  33.65 
 
 		 627 aa  67.4  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1804 aa  67  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  27.31 
 
 		 1162 aa  65.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  30.28 
 
 		 2927 aa  65.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  30.77 
 
 		 1371 aa  65.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  25.06 
 
 		 874 aa  65.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1243 aa  64.3  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  24.68 
 
 		 503 aa  63.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.82 
 
 		 1679 aa  62.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  24.12 
 
 		 890 aa  62  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1059 aa  62.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  28.79 
 
 		 822 aa  61.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  25.81 
 
 		 885 aa  61.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1259 aa  60.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  24.46 
 
 		 5544 aa  60.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  28.44 
 
 		 2296 aa  58.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  25.51 
 
 		 2713 aa  59.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  28.44 
 
 		 1526 aa  58.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  31.34 
 
 		 637 aa  57.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  22.96 
 
 		 540 aa  57.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  29.39 
 
 		 534 aa  56.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  30.39 
 
 		 799 aa  55.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  34.18 
 
 		 429 aa  55.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1139 aa  55.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  25.98 
 
 		 2367 aa  54.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  26.8 
 
 		 4896 aa  54.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  25.98 
 
 		 2411 aa  54.7  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  32.29 
 
 		 1140 aa  54.3  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  28.89 
 
 		 2421 aa  54.3  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  33.33 
 
 		 2772 aa  54.3  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1193 aa  53.9  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  30.95 
 
 		 2454 aa  53.5  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  25.23 
 
 		 694 aa  52.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1228 aa  52.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  31.22 
 
 		 1547 aa  52.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  31.82 
 
 		 750 aa  51.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  29.55 
 
 		 1389 aa  51.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  32.58 
 
 		 3542 aa  51.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  30.95 
 
 		 2807 aa  52  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  27.06 
 
 		 2005 aa  51.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1066 aa  51.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  30.34 
 
 		 652 aa  51.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1488 aa  51.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  29.21 
 
 		 535 aa  50.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  32.89 
 
 		 532 aa  50.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  29.57 
 
 		 886 aa  50.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  28.09 
 
 		 1483 aa  49.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1287 aa  49.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1163 aa  49.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  39.19 
 
 		 969 aa  49.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  28.92 
 
 		 3793 aa  50.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1313 aa  48.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  39.19 
 
 		 963 aa  48.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  29.21 
 
 		 3471 aa  48.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  28.74 
 
 		 792 aa  48.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  32.39 
 
 		 3602 aa  47.8  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  27.66 
 
 		 1620 aa  47.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  30.61 
 
 		 636 aa  47.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  32.88 
 
 		 2980 aa  47  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  30.53 
 
 		 598 aa  46.6  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  30.93 
 
 		 4429 aa  46.6  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>