255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3435 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  100 
 
 		 2367 aa  4665    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  68.33 
 
 		 2421 aa  1704    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  74.82 
 
 		 2454 aa  2021    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  76.61 
 
 		 2807 aa  1953    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  97.36 
 
 		 2411 aa  2855    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  43.82 
 
 		 953 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  44.77 
 
 		 976 aa  488  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  31.9 
 
 		 2772 aa  431  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  48.1 
 
 		 750 aa  384  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  32.63 
 
 		 1976 aa  265  8e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1059 aa  242  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  43.12 
 
 		 4978 aa  228  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  47.47 
 
 		 1259 aa  186  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1969 aa  146  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  26.21 
 
 		 1371 aa  140  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  31.48 
 
 		 1079 aa  127  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  32.22 
 
 		 2418 aa  126  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  25.71 
 
 		 1389 aa  124  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.11 
 
 		 3793 aa  120  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  32.81 
 
 		 627 aa  119  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  26.1 
 
 		 2270 aa  115  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  25.53 
 
 		 822 aa  111  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  32.83 
 
 		 1987 aa  111  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.42 
 
 		 555 aa  107  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  30.38 
 
 		 1527 aa  105  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  27.43 
 
 		 2713 aa  103  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1980 aa  101  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  33.51 
 
 		 2064 aa  100  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  31.43 
 
 		 835 aa  97.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.33 
 
 		 1848 aa  96.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  33.51 
 
 		 2296 aa  96.3  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  32.79 
 
 		 558 aa  96.3  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.54 
 
 		 3227 aa  96.3  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  30.12 
 
 		 743 aa  95.5  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  39.72 
 
 		 799 aa  95.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.45 
 
 		 556 aa  94.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  32.86 
 
 		 551 aa  94.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.68 
 
 		 561 aa  94.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  27.49 
 
 		 792 aa  94.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  30.04 
 
 		 2927 aa  93.6  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  28.17 
 
 		 1129 aa  92.8  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  39.39 
 
 		 4896 aa  91.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  35.44 
 
 		 1162 aa  92  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 		 567 aa  91.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  37.06 
 
 		 707 aa  89.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  25 
 
 		 794 aa  89.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  29.31 
 
 		 636 aa  89  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  31.29 
 
 		 577 aa  89.4  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 2082 aa  88.6  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  31.18 
 
 		 637 aa  89  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  32.57 
 
 		 569 aa  88.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 		 570 aa  88.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.35 
 
 		 554 aa  88.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  29.5 
 
 		 443 aa  88.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.68 
 
 		 563 aa  88.2  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1547 aa  88.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  30.05 
 
 		 1526 aa  87.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  24.98 
 
 		 3542 aa  87.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 449 aa  87.4  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.55 
 
 		 1919 aa  87.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  32.15 
 
 		 553 aa  87  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  25.28 
 
 		 1466 aa  87  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  29.94 
 
 		 477 aa  86.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  28.45 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  31.08 
 
 		 885 aa  85.9  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  28.57 
 
 		 911 aa  85.9  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  28.45 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  25.12 
 
 		 650 aa  85.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  33.56 
 
 		 642 aa  85.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  26.95 
 
 		 815 aa  85.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  29.08 
 
 		 1436 aa  85.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.71 
 
 		 417 aa  85.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  30.31 
 
 		 808 aa  84.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.96 
 
 		 821 aa  84.7  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  37.61 
 
 		 3471 aa  84.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.94 
 
 		 737 aa  84  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  37.32 
 
 		 2416 aa  84  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  29.33 
 
 		 593 aa  83.2  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1329 aa  83.2  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  31.91 
 
 		 579 aa  82.8  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  29.22 
 
 		 778 aa  82.8  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  30.07 
 
 		 560 aa  82.8  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  27.93 
 
 		 784 aa  81.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  32.47 
 
 		 2377 aa  81.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  26.92 
 
 		 4429 aa  81.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  31.43 
 
 		 461 aa  80.1  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  28.66 
 
 		 547 aa  79.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.21 
 
 		 555 aa  79.7  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1287 aa  79.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 		 315 aa  79.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  32.23 
 
 		 4071 aa  79  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  30.3 
 
 		 776 aa  78.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  43.84 
 
 		 3602 aa  78.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  31.06 
 
 		 886 aa  77.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  28.03 
 
 		 890 aa  77.4  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  31.17 
 
 		 376 aa  77.4  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  33.1 
 
 		 6497 aa  77.4  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  41.86 
 
 		 2005 aa  77.4  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  29.05 
 
 		 900 aa  77  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  30.55 
 
 		 554 aa  77  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>