52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0841 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  100 
 
 
2416 aa  4726    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  50.28 
 
 
1331 aa  617  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0837  hypothetical protein  42.09 
 
 
1184 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  41.85 
 
 
1084 aa  530  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0838  hypothetical protein  45.1 
 
 
1046 aa  499  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0834  CHU large protein  42.08 
 
 
909 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  50.6 
 
 
1452 aa  343  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  44.96 
 
 
1223 aa  279  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4916  hypothetical protein  28.36 
 
 
2650 aa  144  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0873  CHU large protein  29.8 
 
 
1053 aa  132  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.539179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0878  hypothetical protein  29.62 
 
 
1051 aa  130  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.599854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  32.47 
 
 
3793 aa  113  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  26.99 
 
 
2807 aa  89.4  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  38.57 
 
 
2411 aa  84.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  38.57 
 
 
2367 aa  84.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  37.5 
 
 
2454 aa  82.4  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  27.18 
 
 
976 aa  82  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  30.61 
 
 
953 aa  81.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0806  hypothetical protein  33.7 
 
 
1351 aa  76.3  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  27.97 
 
 
1329 aa  76.3  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  24.12 
 
 
1436 aa  75.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  37.61 
 
 
4978 aa  70.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  26.38 
 
 
2421 aa  68.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  24.73 
 
 
1021 aa  65.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  27.12 
 
 
1969 aa  63.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  48.75 
 
 
915 aa  62.4  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  28.12 
 
 
2270 aa  61.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  38.33 
 
 
1083 aa  58.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  45.78 
 
 
1332 aa  58.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0803  hypothetical protein  40 
 
 
1114 aa  57  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3105  hypothetical protein  32.43 
 
 
787 aa  55.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.667845  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  30.6 
 
 
1976 aa  55.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  31.14 
 
 
1987 aa  54.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  38.68 
 
 
4896 aa  55.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  35.51 
 
 
1259 aa  54.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  25.27 
 
 
827 aa  53.9  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  22.68 
 
 
1280 aa  53.9  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  30.54 
 
 
1288 aa  53.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  42.27 
 
 
2772 aa  51.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  40.38 
 
 
2418 aa  51.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  34.88 
 
 
891 aa  50.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  26.95 
 
 
989 aa  49.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  25.4 
 
 
4429 aa  49.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  26.58 
 
 
2024 aa  49.3  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  27.23 
 
 
5453 aa  48.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  31.16 
 
 
1108 aa  48.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  27.11 
 
 
1067 aa  48.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  44.59 
 
 
707 aa  47.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.61 
 
 
1068 aa  47  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  42.47 
 
 
673 aa  47  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  23.79 
 
 
3542 aa  46.6  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  38.2 
 
 
1740 aa  46.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>