57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00625 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  100 
 
 
1083 aa  2191    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  34.83 
 
 
827 aa  303  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  36.57 
 
 
1154 aa  114  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  24.05 
 
 
1054 aa  92  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2428  protein of unknown function DUF1028  34.26 
 
 
297 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0704  protein of unknown function DUF1028  34.26 
 
 
287 aa  84.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0130  protein of unknown function DUF1028  33.48 
 
 
353 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1006  hypothetical protein  33.79 
 
 
286 aa  79.3  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.728263 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0971  protein of unknown function DUF1028  33.33 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0491555  normal  0.0527085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2209  hypothetical protein  32.47 
 
 
236 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230458 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0160  hypothetical protein  34.23 
 
 
282 aa  73.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1609  hypothetical protein  34.32 
 
 
289 aa  72.4  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.457391  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0307  hypothetical protein  35.29 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0871  hypothetical protein  33.63 
 
 
288 aa  70.1  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0318  protein of unknown function DUF1028  34.64 
 
 
327 aa  69.3  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4339  protein of unknown function DUF1028  33.33 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0396233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0329  protein of unknown function DUF1028  33.99 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2631  hypothetical protein  30.64 
 
 
224 aa  65.9  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1405  hypothetical protein  33.53 
 
 
285 aa  64.3  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4107  protein of unknown function DUF1028  28.91 
 
 
251 aa  63.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1145  hypothetical protein  36.62 
 
 
301 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2851  hypothetical protein  30.59 
 
 
236 aa  63.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4916  hypothetical protein  28.38 
 
 
2650 aa  61.6  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1274  protein of unknown function DUF1028  35.92 
 
 
302 aa  61.6  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1205  protein of unknown function DUF1028  35.92 
 
 
302 aa  61.6  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3098  hypothetical protein  37.16 
 
 
285 aa  61.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  30.71 
 
 
713 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2258  hypothetical protein  30.41 
 
 
224 aa  58.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  31.58 
 
 
2239 aa  57.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4426  hypothetical protein  32.72 
 
 
310 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0928  protein of unknown function DUF1028  31.36 
 
 
292 aa  57.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4048  protein of unknown function DUF1028  29.78 
 
 
228 aa  57  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2646  protein of unknown function DUF1028  29.49 
 
 
230 aa  56.6  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.475903 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  40.96 
 
 
243 aa  54.7  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0976  hypothetical protein  28.9 
 
 
270 aa  54.7  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0314029 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  30.81 
 
 
1084 aa  54.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1921  putative membrane protein, putative phage gene  29.11 
 
 
321 aa  53.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0828861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0834  CHU large protein  23.55 
 
 
909 aa  52.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3296  hypothetical protein  28.4 
 
 
599 aa  52.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  37.82 
 
 
2416 aa  51.6  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  32.93 
 
 
1441 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0838  hypothetical protein  33.76 
 
 
1046 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  28.74 
 
 
927 aa  49.7  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  30.77 
 
 
1027 aa  48.9  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1192  hypothetical protein  34.1 
 
 
303 aa  48.9  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164754  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2646  hypothetical protein  37.31 
 
 
296 aa  48.9  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  24.66 
 
 
1331 aa  48.9  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0444  hypothetical protein  27.1 
 
 
224 aa  48.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  37.5 
 
 
1202 aa  47.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2045  hypothetical protein  29.68 
 
 
226 aa  47.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4782  peptidase M4 thermolysin  33.98 
 
 
802 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0253013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0217  protein of unknown function DUF1028  28.65 
 
 
324 aa  46.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.974495 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0033  protein of unknown function DUF1028  24.31 
 
 
226 aa  46.2  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0234991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  33.05 
 
 
461 aa  45.4  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  33.82 
 
 
843 aa  45.1  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 
1332 aa  44.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2687  hypothetical protein  28.03 
 
 
224 aa  44.7  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>