43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2209 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2209  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  487  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4107  protein of unknown function DUF1028  32.64 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2428  protein of unknown function DUF1028  32.02 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0704  protein of unknown function DUF1028  29.21 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2851  hypothetical protein  34.91 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  32.47 
 
 		 1083 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4339  protein of unknown function DUF1028  34.64 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0396233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1405  hypothetical protein  30.23 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0619  protein of unknown function DUF1028  29.79 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1192  hypothetical protein  32.2 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0928  protein of unknown function DUF1028  30.17 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0871  hypothetical protein  29.21 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4426  hypothetical protein  34.66 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2631  hypothetical protein  28.48 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1609  hypothetical protein  30.34 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.457391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0976  hypothetical protein  29.89 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0314029 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2258  hypothetical protein  28.12 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0130  protein of unknown function DUF1028  28.72 
 
 		 353 aa  62  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3267  hypothetical protein  33.16 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1145  hypothetical protein  32.75 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1205  protein of unknown function DUF1028  32.16 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1274  protein of unknown function DUF1028  32.75 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0307  hypothetical protein  30.56 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0318  protein of unknown function DUF1028  30.56 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0329  protein of unknown function DUF1028  29.93 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1006  hypothetical protein  30.17 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.728263 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0033  protein of unknown function DUF1028  25.52 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0234991 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0217  protein of unknown function DUF1028  29.91 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3098  hypothetical protein  32.39 
 
 		 285 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0160  hypothetical protein  29.7 
 
 		 282 aa  52  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1921  putative membrane protein, putative phage gene  26.54 
 
 		 321 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0828861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2387  hypothetical protein  26.25 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0590  protein of unknown function DUF1028  26.14 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0883139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2646  protein of unknown function DUF1028  26.7 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.475903 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3100  hypothetical protein  33.83 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3041  protein of unknown function DUF1028  25.9 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04410  hypothetical protein  28.18 
 
 		 293 aa  45.4  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0064  protein of unknown function DUF1028  25.45 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5619  protein of unknown function DUF1028  29.47 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3117  hypothetical protein  31.16 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16540  hypothetical protein  28.84 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0971  protein of unknown function DUF1028  25.68 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0491555  normal  0.0527085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2581  hypothetical protein  24.86 
 
 		 217 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>